结论前置：上班途中发生事故且对方全责时，申请工伤认定与不申请工伤认定在赔偿来源、赔偿范围、法律保障及后续权益维护等方面存在显著区别。以下是对这些区别的详细分析：

一、赔偿来源与性质

1. 申请工伤认定：

   • 赔偿来源：若被认定为工伤，赔偿主要来源于工伤保险基金和用人单位。工伤保险基金将支付医疗费用、康复费用、一次性伤残补助金等，而用人单位则需支付停工留薪期工资、伤残津贴（如适用）等。
   • 性质：工伤赔偿具有社会保障性质，旨在保障职工在因工作原因受到伤害时能够获得及时、有效的经济援助。

2. 不申请工伤认定：

   • 赔偿来源：若不申请工伤认定，则只能依据交通事故责任认定，向事故责任方（即对方）主张民事赔偿。
   • 性质：民事赔偿属于侵权责任范畴，旨在弥补因对方过错行为给受害者造成的损失。

二、赔偿范围与标准

1. 申请工伤认定：

   • 赔偿范围：包括医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、交通食宿费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金、伤残津贴（如适用）、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金（如适用）等。
   • 赔偿标准：根据《工伤保险条例》及相关规定，各项赔偿均有明确的计算标准和支付方式。

2. 不申请工伤认定：

   • 赔偿范围：主要限于因交通事故导致的直接经济损失，如医疗费用、误工费、护理费、营养费、残疾赔偿金（如构成伤残）等。
   • 赔偿标准：依据《民法典》侵权责任编及相关司法解释，赔偿标准可能因地区、案件具体情况等因素而有所不同。

三、法律保障与后续权益维护

1. 申请工伤认定：

   • 法律保障：一旦被认定为工伤，职工将享受工伤保险的全面保障，包括医疗救治、经济补偿、职业康复等。
   • 后续权益维护：在工伤认定后，职工若对工伤认定结论、伤残等级鉴定结论或工伤保险待遇有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。

2. 不申请工伤认定：

   • 法律保障：仅依靠民事赔偿，可能无法获得与工伤赔偿同等的全面保障。特别是在对方赔偿能力有限或拒绝赔偿的情况下，职工的权益可能难以得到充分保障。
   • 后续权益维护：若对方不履行赔偿义务，职工需通过民事诉讼等途径追讨赔偿，过程可能较为复杂且耗时较长。

四、实际操作建议

• 及时申请工伤认定：在上班途中发生事故且对方全责时，建议职工及时向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请，以确保能够享受工伤保险的全面保障。
• 保留相关证据：在申请工伤认定和主张民事赔偿过程中，职工应妥善保留交通事故责任认定书、医疗证明、费用单据等相关证据材料，以便在需要时提供证明。
• 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议。

综上所述，上班途中发生事故且对方全责时，申请工伤认定与不申请工伤认定在赔偿来源、赔偿范围、法律保障及后续权益维护等方面均存在显著区别。因此，建议职工在符合工伤认定条件的情况下及时申请工伤认定，以充分保障自身合法权益。