关于边远学校教师打卡上下班是否合法的问题，这主要取决于当地教育部门和学校所制定的具体管理制度。以下是对此问题的详细解答：
首先，从法律层面来看，并没有明确的法律法规直接规定边远学校教师是否必须打卡上下班。打卡上下班这一行为，更多地是学校或教育部门为了规范教师考勤、确保教学秩序而采取的一种管理措施。
接下来，我们结合一些具体的管理制度来分析：
考勤制度：
- 许多学校，包括边远地区的学校，都会制定考勤制度来规范教师的出勤情况。这些制度通常会明确规定教师的上下班时间、请假流程、迟到早退的处罚等。
- 在这些制度中，打卡上下班可能被作为一种有效的考勤方式，用于记录教师的出勤情况，确保教师按时到岗，履行教学职责。
教育部门的规定：
- 教育部门在统筹规范社会事务进校园时，也会关注到教师的负担问题。他们可能会要求学校合理安排教师的工作任务，避免过度增加教师的非教学负担。
- 如果打卡上下班被视为一种合理的考勤方式，且不会给教师带来过大的负担，那么教育部门通常会支持学校实施这一制度。
具体学校的实践：
- 以南港镇中心学校为例，其教师管理制度中明确规定了考勤制度，包括签到、会议考勤、活动考勤等。虽然并未直接提及打卡上下班，但签到制度实际上与打卡有相似之处，都是为了记录教师的出勤情况。
- 如果边远学校根据自身情况，认为打卡上下班是一种更为便捷、有效的考勤方式，那么他们完全可以在管理制度中明确规定这一要求。
综合分析：
- 边远学校教师打卡上下班是否合法，主要取决于当地教育部门和学校所制定的管理制度是否合法合规，以及这些制度是否得到了教师的认可和执行。
- 如果打卡上下班是学校为了规范教师考勤、确保教学秩序而采取的一种合理管理措施，且没有违反相关法律法规和教师的合法权益，那么这一行为就是合法的。
- 当然，学校在实施打卡上下班制度时，也应该充分考虑教师的实际情况和合理需求，避免给教师带来过大的负担或不便。
建议：
- 如果您对边远学校教师打卡上下班的合法性有疑问，建议您首先查阅当地教育部门和学校的相关管理制度或规定。
- 如果这些制度或规定中明确规定了打卡上下班的要求，并且您认为这一要求合理合法，那么您应该遵守这一制度。
- 如果您认为这一制度存在不合理或违法之处，您可以向学校或教育部门提出意见或建议，寻求合理的解决方案。