核心结论：案件不起诉且单位受到行政处分的情况下，能否补发工资需分情况讨论，具体如下：

1. 若行政处分与工资扣发无直接关联
   若单位因其他原因（如管理疏漏、制度瑕疵等）受到行政处分，但该处分与员工工资扣发无直接因果关系（例如：工资扣发是基于员工考勤、绩效等内部规定），则单位无义务补发工资。此时需审查工资扣发的合法性依据，若单位内部规定违反《劳动法》或《劳动合同法》（如未足额支付劳动报酬），员工可主张补发。

2. 若行政处分直接导致工资扣发
   若单位因行政处分被要求停产整顿、限期整改等，且处分措施直接导致员工无法提供劳动（如停工停产），根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付工资；超过一个周期的，若劳动者提供了正常劳动，支付标准不得低于当地最低工资；若未提供正常劳动，可按地方规定支付生活费。此时员工有权要求补发相应工资或生活费。

3. 若工资扣发涉及违法情形
   若单位以“行政处分”为由，违法扣发工资（如扣发金额超过法定比例、未履行民主程序制定扣发规则等），员工可依据《劳动合同法》第三十八条主张单位补发工资，并可要求解除劳动合同并获得经济补偿。

行动建议：

• 第一步：核查单位扣发工资的具体原因及依据（如行政处分文件、内部规章制度、劳动合同条款）；
  
• 第二步：对比扣发行为是否符合《工资支付暂行规定》《劳动合同法》等法定标准；
  
• 第三步：若存在违法情形，可先与单位协商补发，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步细节（如行政处分类型、工资扣发比例等），可向我补充说明，我会为您具体分析。