当行政处罚法中违法事实不清时，行政机关应当依法撤销案件或作出不予处罚决定。具体分析如下：

1. 撤销案件：

   • 法律依据：根据《行政处罚法》的相关规定，行政机关在调查终结后，如果发现违法事实不清、证据不足，不能认定当事人存在违法行为，应当作出撤销案件的决定。
   • 操作流程：行政机关在调查过程中，如果收集到的证据无法充分证明当事人的违法行为，或者证据之间存在矛盾无法排除合理怀疑，行政机关应当依法撤销案件，并告知当事人撤销案件的理由和依据。

2. 不予处罚：

   • 法律依据：同样依据《行政处罚法》，如果行政机关在调查后认为违法事实不成立，或者虽然存在违法行为但情节显著轻微、危害不大，依法可以不予行政处罚的，应当作出不予处罚决定。
   • 操作流程：行政机关在作出不予处罚决定前，应当充分听取当事人的陈述和申辩，对当事人提出的事实、理由和证据进行复核。如果当事人提出的事实、理由或者证据成立，行政机关应当采纳，并据此作出不予处罚决定。同时，行政机关应当将不予处罚决定书送达当事人，并告知其有申请行政复议或提起行政诉讼的权利。

额外建议：

• 行政机关在处理违法事实不清的案件时，应当严格遵守法定程序，确保调查取证的合法性和充分性。
• 如果行政机关在调查过程中发现新的证据或线索，可能改变案件性质的，应当及时重新调查并作出相应处理。
• 当事人对行政机关的处理决定不服的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

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