在行政处罚案件立案后，若出现事实不清、证据不足的情况，可以按照以下方式处理：

1. 补充调查取证：

   • 行政机关在发现案件事实不清、证据不足时，应主动进行补充调查，收集更多相关证据以查清事实。这可能包括询问当事人、证人，调取相关文件、记录，进行现场勘查等。
   • 补充调查的目的是为了完善证据链，确保行政处罚的合法性和合理性。行政机关应充分利用调查手段，确保所收集的证据真实、合法、有效。

2. 撤销立案或不予处罚：

   • 如果经过补充调查后，仍然无法查清事实或证据不足，行政机关应考虑撤销立案。因为行政处罚必须基于确凿的事实和充分的证据，否则将违反法定程序，损害当事人的合法权益。
   • 在某些情况下，即使事实部分清楚，但证据不足以支持行政处罚的，行政机关也可以决定不予处罚或减轻处罚。这体现了行政处罚的公正性和合理性原则。

3. 遵循法定程序与原则：

   • 在处理事实不清、证据不足的行政处罚案件时，行政机关必须严格遵守法定程序，如告知当事人权利、听取当事人陈述和申辩等。
   • 同时，行政机关应坚持合法、公正、公开、及时的原则，确保行政处罚的合法性和有效性。这有助于维护行政机关的公信力，保护当事人的合法权益。

4. 当事人权利保障：

   • 当事人有权对行政机关的调查行为提出异议，并要求行政机关出示相关证据。如果当事人认为行政机关的调查行为违法或侵犯其合法权益，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 在行政处罚过程中，当事人也有权进行陈述和申辩，提供有利于自己的证据和理由。行政机关应认真听取当事人的陈述和申辩，并对其进行充分考虑和评估。

额外建议：

• 对于行政机关而言，加强案件初审和立案审查工作至关重要。通过严格审查案件材料，确保立案的准确性和合法性，可以减少后续处理中因事实不清、证据不足而带来的麻烦。
• 对于当事人而言，在面对行政处罚时，应积极配合行政机关的调查工作，同时保留好相关证据和材料。如果认为行政处罚违法或不当，可以依法维护自己的合法权益。

在处理这类问题时，务必确保所有行动都符合法律法规的规定，以维护行政处罚的公正性和合法性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。