企业员工提出离职，确实是需要提出申请的，但这一申请并不等同于需要得到用人单位的批准才能离职。根据《劳动合同法》第三十七条的明确规定：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。”

这一条款实际上保障了劳动者单方辞职的权利。也就是说，只要劳动者作出了辞职的意思表示，并且是以书面形式提前通知了用人单位（非试用期需提前三十日，试用期需提前三日），那么无需得到用人单位的批准或同意，通知期满后，劳动关系即告解除。

当然，法律也考虑到了用人单位的实际情况，为劳动者的单方解除权设置了这样的预告期，这是为了约束劳动者的辞职权，给予用人单位一定的时间来寻找替代的人力资源，避免用人单位因劳动者突然离职而导致工作无法交接，进而影响其正常用工秩序。但法律并不禁止用人单位放弃这段时间的权利，如果用人单位在劳动者提出离职申请后，未等预告期满就作出同意劳动者离职的意思表示，那么双方的劳动关系就会于单位作出批准的意思表示时即告解除。

以您提供的案例为例，刘某在2020年7月16日向某飞行学院提出了辞职申请，并递交了书面辞职申请书。虽然刘某希望能在2020年9月1日前正式离职，但某飞行学院在2020年7月23日就完成了刘某申请辞职的人事审批手续，并送达了“办理调离手续及公物移交会签单”，即作出了同意刘某离职的意思表示。因此，根据法律规定和实际情况，刘某与某飞行学院的劳动关系在2020年7月23日就已解除，而非刘某所主张的2020年9月4日。

所以，企业员工提出离职时，确实需要提出申请，但无需担心用人单位不批准的问题，只要按照法律规定提前通知，并完成必要的离职手续，就可以顺利解除劳动关系。