没有手续的养殖场，在多数情况下会被认定为违章建筑，但具体还需根据养殖场的实际情况和当地政策来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、违章建筑的定义与认定

违章建筑，通常指的是未经规划、土地等主管部门批准，未领取建设工程规划许可证或临时建设工程规划许可证，擅自建筑的建筑物和构筑物。对于养殖场而言，如果其建设未遵循相关法律法规，未办理必要的手续，那么很可能被认定为违章建筑。

二、养殖场手续的重要性

养殖场的建设和运营，需要办理一系列的手续，包括但不限于土地使用审批、生产设施用地备案、环境影响评价、排污许可证、动物防疫条件合格证等。这些手续的办理，不仅是对养殖场合法性的确认，也是对其建设和运营过程中可能产生的环境、卫生等问题的监管。如果养殖场未办理这些手续，那么其合法性就会受到质疑，进而可能被认定为违章建筑。

三、可能不被认定为违章建筑的特殊情况

尽管手续不全的养殖场在多数情况下会被认定为违章建筑，但也存在一些特殊情况，使得养殖场可能不被认定为违章建筑。例如：

1. 历史原因：如果养殖场建设于较早时期，当时法律和管理规定尚不完善，且符合当时的用地和建设政策，那么仅因历史原因未办理相关证件的养殖场，不宜简单认定为违章建筑。
2. 符合养殖规划和相关政策，但手续不完善：若养殖场虽未取得全部证件，但已按规定备案，并符合当地养殖规划、土地利用总体规划及环保要求，仅因办证流程繁琐或时间较长导致证件尚未齐全，一般也不会直接认定为违章建筑。此时，通常会给予一定时间要求其完善相关手续。
3. 因政府原因导致无法办证：若因政府部门拖延办理、政策调整等原因导致养殖场未能及时取得证件，责任不在养殖户，因此不应认定为违章建筑。

四、法律后果与建议

如果养殖场被认定为违章建筑，那么可能会面临被拆除、罚款等法律后果。因此，对于养殖户而言，确保养殖场的合法性和合规性至关重要。以下是一些建议：

1. 提前咨询与了解规定：在建养殖场之前，建议养殖户先咨询当地政府或相关部门，了解具体的办证要求和规定。这样不仅能避免后续纠纷，还能确保养殖场的合法合规性。
2. 遵守法律法规：养殖户应严格遵守国家及地方的法律法规，确保养殖场的建设和运营符合相关规定。
3. 及时完善手续：对于手续不完善的养殖场，应尽快与当地政府或相关部门沟通，争取在规定时间内完善相关手续。

综上所述，没有手续的养殖场在多数情况下会被认定为违章建筑，但具体还需根据养殖场的实际情况和当地政策来判断。如果您有关于养殖场手续或违章建筑方面的法律问题，可以直接向我咨询。