因个人原因给公司造成5万元损失，赔偿方式需根据具体情况确定，一般需承担部分或全部赔偿责任，但赔偿范围会受过错程度、公司制度、劳动合同约定及法律规定等因素影响。具体分析如下：

1. 过错程度与责任比例
   若损失由员工故意或重大过失导致（如违规操作、疏忽大意等），员工需承担主要赔偿责任；若为一般过失（如轻微疏忽），公司可能仅要求部分赔偿或通过其他方式分担责任。例如，员工因故意泄露商业秘密导致公司损失5万元，可能需全额赔偿；若因未及时检查设备导致生产事故，可能按过错比例分担。

2. 公司制度与劳动合同约定
   若公司规章制度或劳动合同中明确规定了损失赔偿条款（如“因员工过失造成损失的，按损失金额的20%-50%赔偿”），则需优先适用约定。但约定需符合法律规定（如赔偿金额不得超过劳动者月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准），否则可能被认定无效。

3. 法律规定与赔偿范围
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。若劳动合同无约定，公司可要求赔偿，但需满足以下条件：

   • 损失与员工行为存在直接因果关系；
     
   • 赔偿金额合理（通常不超过劳动者月工资的20%，且扣除后工资不低于最低工资标准）；
     
   • 公司已履行告知义务（如制度公示、合同约定等）。
     若损失超出员工承受能力（如员工月工资仅5000元，要求赔偿5万元明显不合理），法院可能酌情调整赔偿金额。

4. 协商与诉讼途径
   若双方对赔偿金额或方式存在争议，可通过协商解决；协商不成，公司可申请劳动仲裁或提起诉讼。仲裁/诉讼中，公司需举证证明损失金额、员工过错及因果关系，员工可提出抗辩（如制度未公示、赔偿条款无效等）。

建议：若您面临此类情况，可先与公司协商赔偿方案（如分期赔偿、以工资抵扣等）；若协商无果，需收集证据（如劳动合同、制度文件、损失证明等）以应对仲裁或诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询。