用工单位与用人单位在合同中约定经济补偿金由用工单位支付，这一约定本身是合法的，但具体是否需要支付以及支付的标准需根据实际情况和法律规定来确定。以下是对此问题的详细解析：

一、合法性分析

1. 合同自由原则：在民事法律关系中，合同双方有权在平等、自愿的基础上，就相关事项进行约定。因此，用工单位与用人单位在合同中约定经济补偿金的支付主体，并不违反法律的强制性规定，该约定本身是合法的。

2. 经济补偿金的性质：经济补偿金是用人单位在解除或终止劳动合同时，依法向劳动者支付的一种补偿。其目的在于保障劳动者在失去工作后的基本生活需要，并促进劳动关系的和谐稳定。因此，经济补偿金的支付主体通常是用人单位，但并不意味着不能由其他主体（如用工单位）来承担。

二、具体情形分析

1. 用工单位与用人单位为同一主体时：若用工单位与用人单位为同一主体，那么经济补偿金的支付主体自然就是该主体本身。此时，合同中关于经济补偿金由用工单位支付的约定，实际上就是由用人单位自己支付，这并不违反法律规定。

2. 用工单位与用人单位为不同主体时：

   • 合法约定：若用工单位与用人单位在合同中明确约定，经济补偿金由用工单位支付，且该约定不违反法律法规的强制性规定，也不损害劳动者的合法权益，那么该约定是有效的。在实际操作中，用工单位应按照约定向劳动者支付经济补偿金。
   • 需注意的情形：然而，也需要注意到，如果用工单位与用人单位之间的约定损害了劳动者的合法权益（例如，通过约定免除用人单位的法定责任、排除劳动者权利等），那么该约定可能因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。此外，如果用工单位未按照约定支付经济补偿金，劳动者仍有权向用人单位主张权利，用人单位在承担责任后，可以依据合同约定向用工单位追偿。

三、经济补偿金的支付标准与情形

无论经济补偿金的支付主体是用人单位还是用工单位，其支付标准与情形均应遵循《劳动合同法》及相关规定。具体来说，经济补偿金的支付标准主要依据劳动者在本单位的工作年限和月工资水平来确定。同时，也存在一些特定的情形下，用人单位（或用工单位）需要向劳动者支付经济补偿金，如劳动者被迫解除劳动合同、用人单位提出解除劳动合同并与劳动者协商一致、劳动合同订立时的客观情况发生重大变化导致合同无法履行等。

四、建议与注意事项

1. 明确约定：为了避免后续纠纷，用工单位与用人单位在合同中应明确约定经济补偿金的支付主体、支付标准、支付时间等关键条款。

2. 遵守法律法规：在约定经济补偿金时，应确保不违反法律法规的强制性规定，也不损害劳动者的合法权益。

3. 及时支付：一旦约定了经济补偿金的支付，用工单位（或用人单位）应按时足额支付给劳动者，以避免不必要的法律风险。

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