针对您提出的“医疗机构使用未取得疫苗接种证人员怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规和具体案例为您提供的详细解答。
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国疫苗管理法》及《预防接种工作规范》的相关规定，预防接种人员必须取得《预防接种工作人员上岗证书》才能上岗进行预防接种工作。这是为了确保疫苗接种的安全性和有效性，保障受种者的健康权益。
如果医疗机构使用了未取得《预防接种工作人员上岗证书》的人员进行疫苗接种，那么这一行为将构成违法。具体来说，这种违法行为将违反《中华人民共和国疫苗管理法》第四十四条关于接种单位应当具备的条件，以及该法第八十七条关于违反规定接种疫苗的处罚条款。
根据这些规定，医疗机构使用未取得疫苗接种证人员的处罚措施可能包括：
警告：由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令改正，并给予警告。
没收违法所得：如果医疗机构通过这一违法行为获得了违法所得，那么这些违法所得将被没收。
对责任人员的处分：情节严重的，对主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予警告直至撤职处分。
暂停执业活动：责令负有责任的医疗卫生人员暂停一年以上十八个月以下执业活动。
吊销执业证书：如果造成严重后果，对主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予开除处分，并由原发证部门吊销负有责任的医疗卫生人员的执业证书。
综上所述，医疗机构使用未取得疫苗接种证人员进行疫苗接种是违法的，并将面临一系列严重的法律后果。因此，医疗机构应当严格遵守相关法律法规，确保所有预防接种人员都具备合法的上岗证书，以保障疫苗接种的安全性和有效性。