医疗机构未按规定接种疫苗，将可能面临行政处罚、民事赔偿以及刑事责任（在严重情况下）等多方面的法律后果。以下是对这些法律后果的详细分析：
一、行政处罚
警告与罚款：
- 根据《疫苗管理法》等相关法律法规，医疗机构若未按照规定接种疫苗，首先可能面临卫生健康主管部门的警告，并可能被处以一定数额的罚款。罚款的具体数额会根据违规情节的严重程度、造成的后果等因素综合确定。
责令改正与停业整顿：
- 除了警告和罚款外，卫生健康主管部门还可能责令医疗机构立即改正违规行为，并在必要时采取停业整顿等措施，以确保其符合疫苗接种的相关规定。
吊销执业许可：
- 在严重违规或多次违规的情况下，卫生健康主管部门有权吊销医疗机构的执业许可，从而剥夺其从事医疗活动的资格。
二、民事赔偿
患者损害赔偿：
- 如果医疗机构未按规定接种疫苗导致患者受到损害，如感染疾病、出现不良反应等，医疗机构可能需要承担民事赔偿责任。赔偿范围通常包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等。
赔偿程序：
- 患者或其家属可以通过与医疗机构协商、申请医疗事故鉴定、提起民事诉讼等途径来寻求赔偿。在诉讼过程中，法院将根据事实和法律规定，判决医疗机构承担相应的赔偿责任。
三、刑事责任（在严重情况下）
医疗事故罪：
- 如果医疗机构未按规定接种疫苗的行为构成医疗事故，且情节严重，相关责任人员可能面临刑事责任的追究。根据《刑法》的相关规定，医疗事故罪是指医务人员由于严重不负责任，造成就诊人死亡或者严重损害就诊人身体健康的行为。
其他相关罪名：
- 除了医疗事故罪外，如果医疗机构或相关责任人员的行为还涉及其他犯罪，如玩忽职守罪、滥用职权罪等，也可能面临相应的刑事责任。
四、建议与措施
加强内部管理：
- 医疗机构应建立健全疫苗接种管理制度，明确接种流程、责任分工和应急预案等，确保疫苗接种工作的规范、有序进行。
提高医务人员素质：
- 医疗机构应加强对医务人员的培训和教育，提高其疫苗接种的专业知识和技能水平，增强其责任意识和法律意识。
加强监管与执法：
- 卫生健康主管部门应加强对医疗机构疫苗接种工作的监管和执法力度，及时发现和纠正违规行为，确保疫苗接种工作的安全、有效进行。
若您遇到医疗机构未按规定接种疫苗的情况，并因此遭受了损害，建议您及时收集相关证据，如医疗记录、接种证明等，并向当地卫生健康主管部门投诉或寻求法律帮助。作为专业律师，我将根据您的具体情况，为您提供专业的法律咨询和代理服务。