针对医疗机构购置不合格疫苗的处理方式，这主要涉及到疫苗管理法规以及相关的责任追究机制。以下是对此问题的详细解答：

首先，一旦医疗机构被发现有购置不合格疫苗的行为，根据相关法规，如《疫苗管理法》，该机构将会面临一系列的法律责任。具体来说，机构可能会被责令改正，并给予警告，同时没收违法所得。这是为了对违规行为进行及时的制止和惩罚，防止不合格疫苗进一步流通和使用。

如果医疗机构在接到整改通知后仍然拒不改正，那么将会面临更为严厉的处罚。根据法规，对接种单位、疫苗上市许可持有人、疫苗配送单位，可以处十万元以上三十万元以下的罚款。这一罚款数额的设定，旨在通过经济手段对违规行为进行震慑，确保疫苗流通和使用的合规性。

此外，如果情节严重，如造成重大公共卫生事件或严重损害公众健康，那么处罚将会更加严厉。机构可能会被处违法储存、运输疫苗货值金额三倍以上十倍以下的罚款，货值金额不足十万元的，还会按十万元计算。这种高额的罚款，旨在对严重违规行为进行严厉打击，维护公共卫生安全和公众健康权益。

除了经济处罚外，对于医疗机构的主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员，如果其行为构成违规或违法，还可能面临行政处分。这包括警告、撤职等处分，甚至可能被原发证部门吊销执业证书。这些措施旨在追究相关人员的责任，防止类似违规行为的再次发生。

综上所述，医疗机构购置不合格疫苗的行为将会面临严格的法律责任追究。这包括经济处罚、行政处分等一系列措施，以确保疫苗流通和使用的合规性和安全性。同时，也提醒所有医疗机构和从业人员，必须严格遵守相关法律法规和规章制度，确保疫苗的质量和安全，保障公众的健康权益。