针对您提出的“宠物店非法打疫苗怎么处罚”的问题，这主要涉及到动物诊疗活动的合法性和相关法律法规的适用。以下是我为您提供的详细解答：
首先，宠物店若未取得动物诊疗许可证而从事动物诊疗活动，包括为宠物注射疫苗等，是违反相关法律法规的行为。根据《中华人民共和国动物防疫法》以及《动物诊疗机构管理办法》的规定，从事动物诊疗活动的机构必须取得动物诊疗许可证，并在规定的诊疗活动范围内开展活动。
对于非法打疫苗的宠物店，一旦被发现，将面临以下处罚：
责令停止诊疗活动：县级以上地方人民政府农业农村主管部门会责令该宠物店立即停止非法诊疗活动，以防止其继续违法并可能对宠物健康造成进一步危害。
没收违法所得：如果宠物店在非法诊疗活动中收取了费用，这些费用将被视为违法所得，并会被没收。不过，如果违法所得已经退赔给消费者，如南宁叮当猫宠物店案例中所示，则不再进行没收。
罚款：根据违法情节的严重程度，宠物店还将面临罚款。具体罚款金额根据《中华人民共和国动物防疫法》第一百零五条第一款的规定，违法所得一倍以上三倍以下罚款；若违法所得不足三万元的，则并处三千元以上三万元以下罚款。在实际操作中，各地农业农村主管部门还会参照当地的农业行政处罚自由裁量权适用规定和细化基准来确定具体罚款金额。
以南宁叮当猫宠物店为例，该店因未取得动物诊疗许可证而从事动物诊疗活动，被南宁市西乡塘区农业农村局立案调查。最终，该店因违法情节较轻（违法所得一万元以下），被责令停止诊疗活动，并因已退赔投诉人而不存在没收违法所得的情况，但根据相关规定仍可能面临三千元以上一万五千元以下的罚款（具体罚款金额需根据当地细化基准确定）。
综上所述，宠物店非法打疫苗将面临严重的法律后果，包括责令停止诊疗活动、没收违法所得和罚款等。因此，我建议宠物店在从事任何动物诊疗活动前，务必确保已取得合法的动物诊疗许可证，并严格遵守相关法律法规和诊疗技术规范，以保障宠物健康和消费者权益。