周六迟到1小时是否扣全勤，主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度：
- 许多公司会在其规章制度中明确规定考勤制度，包括迟到、早退、旷工等行为的处理方式。如果公司的规章制度中明确规定了周六迟到1小时将扣除全勤奖，那么员工在迟到的情况下，公司有权按照规章制度扣除全勤奖。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。因此，如果公司的规章制度是依法制定并公示的，且内容合法合理，那么对员工具有约束力。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了周六迟到1小时将扣除全勤奖，那么员工在迟到的情况下，公司同样有权按照合同约定扣除全勤奖。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第十七条，劳动合同应当具备以下条款：…（六）劳动报酬；…（八）劳动纪律；…。因此，劳动合同中可以约定关于全勤奖的扣除条件。
特殊情况考虑：
- 如果员工迟到是由于不可抗力因素（如交通堵塞、突发疾病等）导致的，且能够提供相关证据，那么公司可能不会扣除全勤奖。但这种情况需要具体分析，且员工需要承担举证责任。
- 另外，如果公司的规章制度或劳动合同中未明确规定周六迟到扣除全勤奖的情况，那么公司可能无权直接扣除。此时，员工可以与公司进行协商，或者向劳动监察部门投诉。
建议：
- 作为员工，应当仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解自己的权利和义务。
- 如果对公司的考勤制度或全勤奖扣除有疑问，可以及时向公司人力资源部门或上级领导咨询。
- 如果认为公司的行为侵犯了自己的合法权益，可以与公司进行协商，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
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