针对您提出的“机关单位工勤人员被刑事拘留单位会怎么处理”的问题，以下是我根据相关法律法规和单位处理流程，为您提供的详细解答：

一、初步核实与了解情况

当机关单位得知工勤人员被刑事拘留时，首要任务是迅速与执法机关（如公安机关或人民检察院）取得联系，核实拘留的具体原因、时间、地点等详细信息。这一步骤至关重要，它有助于单位全面了解事件背景，为后续处理提供准确依据。

二、立即暂停职务与停发工资

在确认工勤人员被刑事拘留的事实后，单位应依据内部规章制度和相关法律法规，立即暂停其工作职务，并停发工资。此时，单位可以改为发放生活费，以保障被拘留人员的基本生活需求。这一措施旨在维护单位的正常秩序，防止因人员缺位而引发的工作混乱。

三、密切关注司法进程与判决结果

单位在暂停职务的同时，应密切关注司法机关的处理进程和最终判决结果。这包括了解案件的侦查、审查起诉、审判等各个阶段的情况，以及最终的判决结果（如无罪释放、有罪判决等）。这一步骤对于单位后续的处理决策至关重要。

四、根据判决结果作出相应处理

1. 无罪释放：若工勤人员经司法机关查明无罪并释放，单位应立即恢复其工作和工资待遇，并补偿因拘留而造成的损失（如工资差额、精神损害等）。同时，单位可以与被拘留人员进行沟通，了解其心理状态，提供必要的心理支持和帮助。

2. 有罪判决：若工勤人员被依法判处刑罚，单位将依据《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关法律法规，给予相应的处分。具体来说：

   • 被依法判处刑罚的，将给予降低岗位等级或撤职以上处分；
   • 被判处有期徒刑以上刑罚的，给予开除处分；
   • 行政机关任命的事业单位工作人员被依法判处刑罚的，同样给予开除处分。

五、保障职工权益与单位稳定

在处理过程中，单位应充分尊重被拘留人员的合法权益，确保处理程序的公正性和合法性。同时，积极与被拘留人员及其家属沟通，解释处理决定的原因和依据，并告知申诉渠道和程序。此外，对于因拘留无法履行工作职责的工勤人员，单位应安排其他人员接替其工作，以确保单位正常运转。

六、咨询专业律师意见

鉴于此类问题的复杂性和敏感性，建议单位在处理过程中咨询专业律师或法律顾问的意见。他们可以提供专业的法律建议，帮助单位确保处理的合法性和合理性，维护单位的稳定和谐。

综上所述，机关单位工勤人员被刑事拘留时，单位应依据相关法律法规和内部规章制度，采取一系列措施来妥善处理此事。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时与我联系。