在建工程抵押通常包含土地使用权。以下从法律依据、实际操作和特殊情况三个角度，为您详细分析这一问题：

一、法律依据层面

1. 《中华人民共和国民法典》第三百九十七条明确规定：以建筑物抵押的，该建筑物占用范围内的建设用地使用权一并抵押。以建设用地使用权抵押的，该土地上的建筑物一并抵押。抵押人未依据前款规定一并抵押的，未抵押的财产视为一并抵押。这一条款直接确立了“房地一体”的抵押原则，即在建工程作为建筑物的一种形式，其抵押必然包含占用的土地使用权。

2. 《中华人民共和国城市房地产管理法》第三十二条也规定：房地产转让、抵押时，房屋的所有权和该房屋占用范围内的土地使用权同时转让、抵押。这一条款同样强调了房屋与土地使用权的不可分割性，在建工程抵押时，土地使用权自然随之抵押。

3. 《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第三十三条进一步规定：土地使用权抵押时，其地上建筑物、其他附着物随之抵押。地上建筑物、其他附着物抵押时，其使用范围内的土地使用权随之抵押。这再次印证了土地使用权与建筑物在抵押时的紧密关联。

二、实际操作层面

1. 抵押登记要求：在办理在建工程抵押登记时，相关部门会要求提供国有土地使用权证、建设用地规划许可证等文件。这些文件的提交，本身就意味着土地使用权是抵押的重要组成部分。只有土地信息清晰、合法，才会予以办理抵押登记手续，确保抵押权的设立具有明确的范围和依据。

2. 评估价值考量：金融机构在评估在建工程抵押价值时，会综合考虑土地价值和在建工程价值。土地作为房地产开发的基础要素，其地理位置、用途、规划条件等都会对在建工程的整体价值产生重大影响。因此，土地的价值是评估的重要组成部分，进一步证明了在建工程抵押包含土地使用权。

3. 处置程序关联：当抵押权人需要实现抵押权时，必须通过拍卖或变卖在建工程及其占用范围内的土地使用权来清偿债务。这种处置方式的关联性，再次印证了土地属于抵押范围的事实。

三、特殊情况说明

1. 划拨土地的特殊处理：如果在建工程所占用的土地是划拨土地，情况则较为复杂。划拨土地是国家无偿提供给用地者使用的土地，一般用于公益事业或特定行业。在以划拨土地上的在建工程进行抵押时，需要经过相关部门的批准，并且可能需要补缴土地出让金。这是因为划拨土地的使用权具有一定的限制，不能直接进入市场流通，只有通过特定的程序将其转化为出让土地后，才能符合抵押的要求。但即便如此，一旦满足抵押条件，土地使用权仍会随在建工程一并抵押。

2. 分别抵押的限制：虽然理论上土地和在建工程可以分别抵押，但在实际操作中，由于房地一体的原则，很难实现真正的分别抵押。即使分别办理了抵押登记，在实现抵押权时也会面临诸多困难。例如，当债务人无法履行债务时，抵押权人可能难以单独处置土地或在建工程而不影响另一方的权益。因此，在实践中，通常会将在建工程和其所占用的土地作为一个整体进行抵押。

综上所述，在建工程抵押通常包含土地使用权，这是由法律规定和实际操作共同决定的。如果您有在建工程抵押方面的法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。