乡政府收取农民建房土地有偿使用费是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从合法与不合法两种情形进行详细分析：
合法情形
基于地方政策与法定程序
- 说明：部分地区为规范宅基地管理，对超出规定面积或“一户多宅”等情况实行有偿使用制度。若该制度经合法程序制定（如经过村民会议或村民代表会议讨论决定，并进行了公示），且符合相关法律法规的规定，则乡政府收取宅基地有偿使用费是合法的。
- 实例：某县出台政策，对超标准面积的宅基地收取有偿使用费，村民赵某按规定缴纳，此收费行为合法。
用于公共利益且程序合规
- 说明：如果乡政府收取的费用明确用于村里的基础设施、公共设施建设或公益事业上，如改善村庄居住环境、统一进行道路、水电等基础设施建设等，且决策过程公开透明，经过法定程序，那么这种收费行为可能具有合法性。
- 实例：乡政府为修建村内道路，经合法程序决定向建房村民收取一定费用，用于道路建设，此收费行为在符合相关条件的情况下是合法的。
不合法情形
无法律依据或政策支持
- 说明：任何未经法律法规或地方政策明确授权的收费项目，均属不合法收费。乡政府若擅自以建房资格为由向村民收取费用，且无法提供明确的法律依据或政策支持，则此行为不合法。
- 实例：某乡政府未经批准，擅自设定“建房管理费”项目，向建房村民收取费用，此行为因无法律依据而不合法。
违反法定程序
- 说明：即使存在收费的法律依据或政策支持，但若乡政府未按照法定程序进行（如未公示、未召开村民会议讨论等），则收费行为同样不合法。
- 实例：某乡政府未履行法定程序，直接向建房村民收取费用，未进行公示或召开村民会议讨论，此收费因程序违规而不合法。
侵犯村民权益
- 说明：乡政府收取的费用若给村民造成过大的经济负担，或剥夺了经济困难村民公平获得宅基地建房的机会，则可能侵犯了村民的合法权益，此行为不合法。
- 实例：乡政府设定过高的建房费用，导致部分村民无法承担，从而无法获得宅基地建房，此行为因侵犯村民权益而不合法。
应对措施与建议
若村民认为乡政府收取建房土地有偿使用费存在不合法或不合理之处，可采取以下措施维护自身权益：
- 向相关部门反映：向乡镇政府、县级农业农村部门等相关政府部门反映情况，请求调查处理。
- 寻求法律援助：咨询专业的法律顾问或律师（即向我咨询），获取法律意见和支持。
- 法律途径维权：通过法律途径维护自身权益，如提起行政诉讼或民事诉讼等。
综上所述，乡政府收取农民建房土地有偿使用费的合法性需根据具体情况综合判断。村民应密切关注乡政府的决策过程和费用使用情况，确保自身权益不受侵害。如遇问题，应及时采取措施维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。