农民建房时收取耕地开垦费是否合法，需分情况讨论：

1. 若农民建房占用的是原有宅基地或符合规划的建设用地：

   • 在这种情况下，农民建房并未占用新的耕地，因此不应收取耕地开垦费。耕地开垦费通常是为了补偿因建设占用耕地而导致的耕地减少，确保耕地总量动态平衡而设立的费用。如果农民并未占用耕地，则无需承担此费用。

2. 若农民建房确实占用了耕地：

   • 根据相关法律法规，占用耕地进行非农业建设（如建房）需要依法办理农用地转用审批手续，并可能需要缴纳耕地开垦费。这是为了确保耕地的保护和合理利用，防止耕地资源的过度消耗。
   • 但关键在于收费的合法性和合理性：
     • 合法性：收费必须依据明确的法律法规进行，且必须由具有收费权限的政府部门或机构收取。如果收费行为没有法律依据或超越了法定权限，那么这种收费就是不合法的。
     • 合理性：即使收费有法律依据，也必须确保收费标准的合理性和透明性。收费标准应该根据耕地的质量、位置、用途等因素综合确定，并应公开征求意见，确保农民的知情权和参与权。

法律建议：

• 如果农民在建房过程中被要求缴纳耕地开垦费，应首先核实该费用是否依法收取，以及收费标准是否合理。
• 可以要求收费部门出示相关的法律法规依据和收费标准文件，以确保自己的权益不受侵害。
• 如果认为收费行为不合法或不合理，可以向当地国土资源部门或相关政府部门进行投诉和举报，寻求法律援助和保护。

可能后果：

• 如果农民未依法缴纳耕地开垦费（在确实需要缴纳的情况下），可能会面临行政处罚，如罚款、责令限期改正等。
• 如果收费行为不合法或不合理，农民有权拒绝缴纳，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。

总结：农民建房时是否收取耕地开垦费，取决于是否占用了耕地以及收费的合法性和合理性。农民在面对此类问题时，应保持警惕，核实收费依据和标准，确保自己的权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。