结论：农村自建房政府收费是否合法，需根据具体收费项目和法律依据来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合法收费的情形：

   • 行政事业性收费：如果政府收取的费用属于行政事业性收费，且该收费项目有明确的法律依据，如《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例中规定的土地使用费、耕地开垦费等，且收费标准经过合法程序制定并公示，那么这种收费是合法的。例如，在申请宅基地使用权时，可能需要缴纳一定的土地管理费或登记费。
   • 服务性收费：如果政府或相关部门提供了特定的服务，如规划许可、施工许可等，并因此收取服务费，且该服务费有明确的收费标准和依据，那么这种收费也是合法的。但需注意，服务性收费应当遵循自愿、有偿、公平、合理的原则，不得强制收取或乱收费。

2. 非法收费的情形：

   • 无依据收费：如果政府收取的费用没有明确的法律依据，或者收费项目未经合法程序制定并公示，那么这种收费就是非法的。例如，某些地方政府或部门可能以“管理费”、“协调费”等名义随意收取费用，这种收费行为缺乏法律依据，应予以抵制。
   • 超标准收费：即使收费项目有法律依据，但如果政府或相关部门超过法定标准收取费用，也是非法的。例如，某些地方政府可能擅自提高土地管理费或登记费的收费标准，这种行为同样违反了法律规定。

3. 法律建议：

   • 核实收费依据：在面对政府收费时，首先应当核实该收费项目是否有明确的法律依据，以及收费标准是否合法。可以通过查阅相关法律法规、政策文件或咨询当地政府部门来获取这些信息。
   • 保留证据：如果认为政府收费不合法或存在疑问，应当保留好相关证据，如收费通知、缴费凭证等，以便在后续维权过程中使用。
   • 寻求法律帮助：如果确认政府收费不合法或存在争议，可以向当地法律援助机构或律师寻求帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

法律背景：

• 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，农村宅基地的使用和管理需遵循法定程序和规定，政府或相关部门在行使管理职权时，应当依法收费，并公开收费项目和标准。
• 同时，《中华人民共和国价格法》也规定了政府定价和政府指导价的制定程序和原则，确保收费行为的合法性和合理性。

可能后果：

• 如果政府收费合法且合理，村民应当按时缴纳费用，否则可能面临行政处罚或法律责任。
• 如果政府收费不合法或存在争议，村民有权拒绝缴纳并寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。如果政府或相关部门存在违法行为，还可能面临行政处罚或法律责任。

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