政府使用农村建设用地是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法使用的情况
符合规划和用途管制：
- 政府若依据土地利用总体规划、城乡规划以及村庄规划，将农村建设用地用于符合规划用途的项目，如公共设施、公益事业等，且经过合法的审批程序，那么这种使用是合法的。例如，政府为了改善农村基础设施，在符合规划的前提下，使用农村建设用地建设学校、医院或道路等。
依法征收并补偿：
- 根据《土地管理法》等相关法律法规，政府为了公共利益的需要，可以依法对农村集体土地进行征收，并给予相应的补偿。在征收过程中，政府需遵循法定程序，包括发布征收公告、进行土地现状调查、组织听证、签订补偿协议等。若政府依法完成了这些程序，并支付了合理的补偿，那么其使用被征收的农村建设用地是合法的。
集体经营性建设用地入市：
- 在符合规划、用途管制和依法取得的前提下，农村集体经营性建设用地可以入市流转。政府或企业若通过合法途径（如招标、拍卖、挂牌等）取得这些土地的使用权，并用于符合规定的项目，那么这种使用也是合法的。
非法使用的情况
未经批准擅自使用：
- 若政府未经合法审批程序，擅自使用农村建设用地进行建设或开发，那么这种行为是违法的。例如，政府未经批准就在农村建设用地上建设商业设施或住宅项目。
改变土地用途：
- 政府若将农村建设用地用于非规划用途的项目，如将原本用于公共设施的土地改为商业用途，且未经合法变更程序，那么这种使用也是违法的。
未依法补偿或补偿不足：
- 在征收农村集体土地时，若政府未依法给予补偿或补偿不足，那么其使用被征收的土地可能构成违法。被征收人有权要求政府按照法定标准进行补偿，并可以通过法律途径维护自己的权益。
法律建议
- 对于政府：应严格遵守土地管理法律法规，确保农村建设用地的使用符合规划、用途管制和依法取得的要求。在征收土地时，应依法履行审批程序，并给予被征收人合理的补偿。
- 对于农民或集体：若发现政府非法使用农村建设用地，应及时向相关部门举报或寻求法律援助。同时，应了解自己的土地权益和补偿标准，确保自己的合法权益不受侵害。
若您对政府使用农村建设用地的合法性有疑问，或遇到相关法律问题，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。