将员工由劳务派遣转变为灵活用工是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

一、合法性判断的核心要素

1. 合同变更的合法性：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。因此，若员工与劳务派遣单位、用工单位三方协商一致，且变更后的灵活用工模式不违反相关法律法规，那么这种转变是合法的。
   • 若未经员工同意，单方面将劳务派遣员工转变为灵活用工，则可能构成违法变更劳动合同，员工有权拒绝并要求继续履行原劳务派遣合同或寻求法律救济。

2. 灵活用工模式的合规性：

   • 灵活用工模式本身并非法律禁止，但需确保符合《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规的规定，如保障员工的劳动权益、提供必要的劳动保护、按时足额支付劳动报酬等。
   • 若灵活用工模式涉及非法用工、逃避劳动监管等违法行为，则这种转变显然是不合法的。

二、可能涉及的法律风险

1. 劳动纠纷风险：

   • 若未经员工同意擅自变更劳动合同，员工可能提起劳动仲裁或诉讼，要求确认变更无效、恢复原劳动关系或要求赔偿损失。
   • 灵活用工模式下，若用工单位未依法履行用人单位义务，如未签订书面劳动合同、未缴纳社会保险等，也可能引发劳动纠纷。

2. 行政处罚风险：

   • 若灵活用工模式违反相关法律法规，如非法用工、未依法缴纳社会保险等，用工单位可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。

三、建议与措施

1. 协商一致：

   • 在转变用工模式前，应与员工进行充分沟通，确保员工了解变更的内容、后果及权益保障措施，并征得员工的同意。

2. 完善合同：

   • 变更劳动合同应采用书面形式，明确变更的内容、期限、劳动报酬、劳动条件等关键条款，确保合同内容合法、有效。

3. 依法用工：

   • 在灵活用工模式下，用工单位应依法履行用人单位义务，如签订书面劳动合同、缴纳社会保险、提供劳动保护等，确保员工的合法权益得到保障。

4. 寻求法律支持：

   • 在转变用工模式过程中，若遇到法律问题或纠纷，应及时咨询专业律师，寻求法律支持，确保用工模式的合法性和合规性。

若您在劳务派遣或灵活用工方面遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。