结论：针对您购房合同中逾期交房赔偿标准不一致（正式合同为万分之一，附加合同为万分之0.5）的情况，您可以通过以下步骤来打官司，具体分析如下：
一、合同效力分析
正式合同与附加合同的关系：
- 首先要明确正式合同与附加合同之间的关系。通常，附加合同是对正式合同的补充或修改，但两者在内容上不应存在根本性冲突。若附加合同中的条款与正式合同条款相冲突，且双方未明确约定以哪份合同为准，则可能引发争议。
条款效力判断：
- 在此情况下，需要判断哪份合同的条款更具有效力。一般来说，如果附加合同是双方真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么附加合同中的条款（如逾期交房赔偿标准）可能被视为对正式合同的修改或补充，从而具有法律效力。但若附加合同存在欺诈、胁迫等情形，或者与正式合同的核心条款相冲突且无法调和，则可能影响其效力。
二、证据收集与准备
合同文本：
- 收集并整理好正式合同和附加合同的文本，确保合同的真实性和完整性。这是后续诉讼的基础证据。
交房通知与沟通记录：
- 收集开发商逾期交房的相关证据，如交房通知、沟通记录等，以证明开发商确实存在逾期交房的行为。
其他相关证据：
- 根据案件需要，可能还需要收集其他相关证据，如购房款支付凭证、房屋现状照片或视频等，以支持您的主张。
三、诉讼策略制定
明确诉讼请求：
- 根据合同条款和实际情况，明确您的诉讼请求。在此案例中，您可能要求开发商按照正式合同中的赔偿标准（万分之一）支付逾期交房违约金。
选择管辖法院：
- 根据合同约定或法律规定，选择合适的管辖法院。通常，房屋买卖合同纠纷由房屋所在地人民法院管辖。
准备诉讼材料：
- 撰写起诉状，明确诉讼请求、事实和理由，并附上相关证据材料。同时，准备好答辩状（如需）和其他诉讼文件。
四、诉讼过程与可能结果
诉讼过程：
- 提交起诉状至法院，并缴纳诉讼费。法院受理后，将安排开庭审理。在庭审过程中，双方将就合同效力、逾期交房事实、赔偿标准等问题进行举证、质证和辩论。
可能结果：
- 法院支持正式合同赔偿标准：如果法院认为正式合同中的赔偿标准（万分之一）是双方真实意思的表示，且附加合同中的条款未有效修改或补充该标准，则法院可能支持您的诉讼请求，要求开发商按照正式合同的标准支付违约金。
- 法院支持附加合同赔偿标准或折中处理：如果法院认为附加合同中的条款（万分之0.5）是对正式合同的有效修改或补充，或者考虑到双方利益平衡等因素，法院可能支持附加合同的标准或进行折中处理。
- 法院驳回诉讼请求：如果法院认为您的诉讼请求缺乏事实或法律依据，或者存在其他法定驳回情形，则可能驳回您的诉讼请求。
五、后续行动建议
尊重法院判决：
- 无论法院作出何种判决，都应尊重并执行。如果不服判决结果，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。
考虑和解或调解：
- 在诉讼过程中或判决后，双方也可以考虑和解或调解。通过协商达成一致意见，可以节省诉讼成本和时间，并维护双方的良好关系。
咨询专业律师：
- 在整个诉讼过程中，建议您咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和策略支持。
最后，针对您的情况，我建议您先仔细审查合同条款，收集相关证据，并咨询专业律师以制定合适的诉讼策略。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。