公司停职员工原则上应与员工协商一致，但特定情形下公司有权单方面停职。以下是对此问题的详细分析：

一、协商一致原则

在一般情况下，公司停职员工应当与员工进行协商，并达成一致意见。这是因为停职涉及到员工的切身利益，包括工资、福利、职业发展等，因此公司应当尊重员工的知情权、参与权和表达权。通过协商，可以确保停职决定的合理性和公正性，同时也有助于维护公司与员工之间的和谐关系。

二、公司单方面停职的特定情形

尽管协商一致是原则，但在某些特定情形下，公司有权单方面停职员工。这些情形通常包括：

1. 员工涉嫌严重违反公司规章制度或法律法规：如果员工涉嫌严重违反公司规章制度或法律法规，公司为了维护自身利益和秩序，有权在调查期间对员工进行停职处理。这种情况下，停职是为了防止员工继续从事违规行为，同时也是为了保护公司和其他员工的权益。
2. 员工涉嫌犯罪被依法采取强制措施：如果员工因涉嫌犯罪被依法采取强制措施（如拘留、逮捕等），公司为了配合司法机关的调查工作，也有权对员工进行停职处理。这种情况下，停职是出于法律要求和公司合规管理的需要。
3. 其他紧急情况或特殊原因：除了上述两种情形外，如果公司面临紧急情况或特殊原因（如自然灾害、安全事故等），为了保障公司运营和员工安全，公司也有权在必要时对员工进行停职处理。但这种情况下，公司应当尽快与员工进行沟通，并说明停职的原因和期限。

三、停职期间的权益保障

无论公司是单方面停职还是与员工协商一致停职，都应当保障员工在停职期间的合法权益。这包括但不限于：

1. 工资支付：除非法律法规另有规定或双方另有约定，公司应当按照劳动合同约定的标准支付员工停职期间的工资。
2. 社会保险和福利待遇：公司应当继续为员工缴纳社会保险和提供福利待遇，确保员工在停职期间的基本生活需求得到满足。
3. 复职和补偿：如果停职期满后员工能够复职，公司应当安排员工复职并恢复其原有的工作岗位和待遇。如果因停职给员工造成损失的，公司还应当依法承担赔偿责任。

四、法律建议

对于公司而言，在决定停职员工时应当谨慎行事，并遵循相关法律法规和公司规章制度。如果确实需要停职员工，应当尽快与员工进行沟通并达成一致意见（除非存在上述特定情形）。同时，公司还应当做好停职期间的员工权益保障工作，以避免引发劳动纠纷和法律风险。

对于员工而言，如果遭遇公司单方面停职且认为停职决定不合理或违法时，可以及时向公司提出异议并要求公司说明理由。如果公司无法给出合理理由或拒绝撤销停职决定时，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。

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