在领导指示违规操作导致事故的情况下，责任认定并非单一由纪委来判定，而是需要根据具体情况，从员工、领导以及公司等多个角度进行综合考量，明确各自的责任。以下是对此问题的详细分析：
一、责任认定
员工责任：
- 员工虽受领导指令，但若明知操作违规仍执行，并不能完全免除其责任。员工有义务对工作行为的合规性进行基本判断，并知晓违规操作可能带来的风险。若员工能证明曾向领导指出违规风险但被忽视，其责任可相对减轻。
- 在某些情况下，员工可能与领导共同承担责任或承担次要责任，这取决于员工对违规操作的知情程度、是否采取了阻止措施以及事故的具体后果。
领导责任：
- 领导下达违规指令，对事故的发生起主导作用，通常需承担主要责任。领导负有管理和监督职责，其指令导致的事故属于管理失误。领导可能面临民事赔偿、行政处罚乃至刑事责任，具体取决于事故的严重程度和违规情节。
- 在重大责任事故中，若领导指令导致严重后果，如人员伤亡或重大财产损失，其很可能成为主要的犯罪责任人。
公司责任：
- 公司作为雇主，有责任确保工作环境的安全和合规。若公司内部的安全操作规程和规章制度不完善，或未对员工进行充分的安全培训，公司也可能需承担一定的责任。
- 若公司有明确规定且员工已遵守，但领导仍强制违规操作，公司责任可能相对减轻，但仍需承担管理不善的责任。
二、可能涉及的法律后果
民事赔偿责任：
- 事故造成的人员伤亡、财产损失等，涉事单位（包括公司、领导、员工等）需承担民事赔偿责任。员工和领导根据过错程度分担相应费用。保险赔付后不足部分，由单位及相关人员承担。
行政处罚：
- 相关政府部门（如安全生产监管部门）会根据事故严重程度和违规情况，对单位和责任人员进行处罚，包括罚款、停产整顿、警告、吊销资格证书等。
刑事责任：
- 若事故后果严重，构成重大责任事故罪等罪名，员工和领导都可能被追究刑事责任。量刑依据犯罪情节、危害后果等因素确定。
三、员工的应对措施
及时报告：
- 事故发生后，员工应立即向单位及相关部门如实报告事故情况，特别是领导指令违规操作的关键事实，避免隐瞒或歪曲。
保留证据：
- 保存所有与违规指令相关的证据，如书面指令、聊天记录、通话录音等。这些证据对于后续责任认定至关重要。
配合调查：
- 积极配合相关部门的调查工作，如实陈述事情经过和自己的行为、所知情况，确保调查结果的准确性。
法律维权：
- 若员工认为自己在事故中无责任或责任较轻，但被错误追究责任，或对责任认定有异议，应及时向我咨询，了解自己的权利和义务，通过合法途径维护自身权益。
总结来说，在领导指示违规操作导致事故的情况下，责任认定需要综合考虑员工、领导以及公司等多个方面的因素。员工在面对此类情况时，应采取积极措施保护自己，并及时寻求法律帮助以确保权益得到妥善维护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。