结论：失职造成公司经济纠纷并已协商退赔损失后多年退休，一般情况下不会因之前的失职行为在退休后再次被追责或影响退休待遇，但需注意是否存在特殊情况或后续法律风险。以下从不同角度进行分析：
一、已协商退赔损失的法律后果
民事责任方面：
- 您因失职给公司造成经济纠纷，但已经与公司协商并退赔了损失，这通常意味着双方就民事赔偿部分已经达成和解。在民事法律关系中，一旦双方达成和解并履行完毕，该民事纠纷即告终结，您不再对公司承担进一步的赔偿责任。
刑事责任方面：
- 如果您的失职行为并未构成犯罪，或者虽然构成犯罪但已经过了追诉时效，或者已经受到刑事处罚并执行完毕，那么您在刑事方面也不再承担责任。
- 如果您的失职行为涉嫌犯罪，但公司选择不追究刑事责任，或者已经通过协商退赔损失的方式获得了公司的谅解，这通常也会作为量刑时的考虑因素，可能减轻或免除您的刑事责任。
二、退休后的法律影响
退休待遇方面：
- 退休待遇主要依据您的工龄、缴费年限、缴费基数等因素确定，与您之前的失职行为及退赔情况无直接关联。因此，一般情况下，您的退休待遇不会因之前的失职行为而受到影响。
后续法律风险方面：
- 虽然您已经退休，但如果您的失职行为涉及违法犯罪，且未被发现或未过追诉时效，理论上仍存在被追责的风险。不过，这种情况较为罕见，且需要具体的证据和法律程序来支持。
- 另外，如果您的失职行为给公司造成了重大损失，且公司认为您的行为构成严重违反公司规章制度或职业道德，公司可能会在您在职期间采取相应的纪律处分措施，如警告、记过、降职、解雇等。但这些措施通常在您在职期间执行，退休后一般不再追溯。
三、特殊情况下的法律考量
如果失职行为涉及重大经济损失或严重违法：
- 即使您已经退休，如果相关部门或公司发现您的失职行为涉及重大经济损失或严重违法，且未过追诉时效，可能会启动相应的法律程序进行追责。不过，这种情况需要具体的证据和法律程序来支持，且较为罕见。
如果退休后被发现之前存在未了结的法律责任：
- 如果您在退休后被发现之前存在未了结的法律责任，如未退赔完的损失、未履行的法律义务等，可能会面临相应的法律后果。但这种情况通常与您之前的协商退赔情况不符，因为一旦协商退赔完毕，即意味着双方的法律关系已经终结。
建议：
- 您已经与公司协商退赔了损失，且已经退休多年，一般情况下无需过于担心之前的失职行为会对您产生进一步的法律影响。
- 如果您对之前的失职行为或退赔情况存在疑虑，或者担心可能存在的法律风险，可以咨询专业律师进行详细评估和指导。不过，作为孙少卿律师，我建议您如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。