交通事故双方当事人自行达成赔偿协议后，是可以再到人民调解委员会进行确认的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

法律背景与依据

根据《中华人民共和国人民调解法》的相关规定，人民调解委员会是依法设立的调解民间纠纷的群众性组织。当事人双方在平等、自愿的基础上，可以就交通事故赔偿等民间纠纷向人民调解委员会申请调解。即使双方已经自行达成了赔偿协议，仍然可以选择到人民调解委员会进行确认，这有助于增强协议的合法性和执行力。

确认的意义与作用

1. 增强协议的法律效力：经过人民调解委员会确认的赔偿协议，具有更强的法律效力。一旦一方不履行协议，另一方可以依据确认后的协议向人民法院申请强制执行。
2. 提供第三方见证：人民调解委员会作为第三方机构，其确认行为可以为双方提供一个公正、中立的见证，有助于减少后续纠纷的发生。
3. 简化诉讼程序：如果双方在赔偿问题上存在争议，且已经自行达成了协议但担心对方反悔，通过人民调解委员会确认可以作为一种预防性措施，避免未来可能涉及的诉讼程序。

实际操作流程

1. 提交申请：双方当事人可以向当地的人民调解委员会提交书面申请，请求对已经达成的赔偿协议进行确认。
2. 审查协议：人民调解委员会会对双方提交的赔偿协议进行审查，确认其是否合法、自愿、公平。
3. 出具确认书：如果协议符合相关要求，人民调解委员会会出具确认书，对协议的内容进行确认，并加盖公章。

注意事项

1. 协议内容合法：双方自行达成的赔偿协议必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，否则即使经过人民调解委员会确认，也可能被认定为无效。
2. 自愿原则：双方必须是在平等、自愿的基础上达成赔偿协议，任何一方不得强迫对方接受不合理的赔偿条件。
3. 及时确认：虽然法律没有规定必须在达成协议后多长时间内进行确认，但为了尽早确定协议的法律效力，建议双方在达成协议后尽快到人民调解委员会进行确认。

可能的法律后果

如果双方自行达成的赔偿协议未经人民调解委员会确认，且后续发生纠纷，一方可能无法直接依据协议向人民法院申请强制执行。而经过确认的协议，则具有更强的法律效力，有助于保护双方的合法权益。

综上所述，交通事故双方当事人自行达成赔偿协议后，再到人民调解委员会进行确认是一个明智的选择。这不仅可以增强协议的法律效力，还可以为双方提供一个公正、中立的见证，减少后续纠纷的发生。如果您在交通事故赔偿方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。