针对您提出的“用转基因豆油标注食用油如何处罚”的问题，这主要涉及到《中华人民共和国食品安全法》中关于转基因食品标识的规定。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据
根据《中华人民共和国食品安全法》第六十九条，生产经营转基因食品应当按照规定显著标示。这是法律对转基因食品标识的明确要求，旨在保护消费者的知情权和选择权。
二、违规性质与处罚
违规性质：
- 如果商家在销售食用油时，未明确标注其含有转基因成分，即构成了违反食品安全法律法规的行为。这种行为侵犯了消费者的知情权，使得消费者在购买时无法做出基于充分信息的选择。
处罚措施：
- 根据《中华人民共和国食品安全法》第一百二十五条，对于生产经营转基因食品未按规定显著标示的，监管部门将没收违法生产经营的食品，并可以没收用于违法生产的工具、设备、原料等物品。
- 罚款额度方面，如果货值金额不足一万元，将并处五千元以上五万元以下罚款。具体罚款金额将根据违法情节的严重程度、持续时间、货值金额以及社会影响等因素综合确定。
三、处罚合理性的判断
- 处罚的合理性需根据具体法律法规、违法情节及当地处罚标准综合判断。如果商家的违法情节严重，如长时间未标注、货值金额大或造成了不良社会影响，那么罚款5000元甚至更高可能是合理的。
- 反之，如果商家的违法情节轻微，且罚款金额超出了当地法规规定的范围，那么罚款可能被视为不合理。在这种情况下，商家有权在规定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。
四、建议与措施
商家应遵守法规：
- 商家应严格遵守《中华人民共和国食品安全法》中关于转基因食品标识的规定，确保所有销售的食用油都明确标注是否含有转基因成分。
加强内部管理：
- 商家应加强内部管理，确保采购、生产、销售等各个环节都符合法律法规要求，避免因疏忽或故意隐瞒而导致法律纠纷。
消费者应保护自身权益：
- 消费者在购买食用油时，应仔细查看产品标签，了解产品是否含有转基因成分。如果发现商家未按规定标注，可以向监管部门举报或寻求法律援助。
综上所述，用转基因豆油标注食用油而未明确标注其转基因成分的行为是违法的，将面临监管部门的处罚。处罚的合理性需根据具体法律法规、违法情节及当地处罚标准综合判断。商家应严格遵守法规，加强内部管理，以维护自身合法权益和消费者权益。