结论：合同总价包含货物和服务但没有分开写的情况下，能否分开开票需视具体情况而定，主要取决于合同条款的约定以及税务方面的规定。

一、合同条款的约定

1. 合同明确约定：如果合同中明确约定了货物和服务的价格可以分开计算，并且也约定了可以分开开票，那么在这种情况下，分开开票是符合合同约定的，也是可行的。

2. 合同未明确约定：如果合同中没有明确约定货物和服务的价格是否可以分开计算，或者没有约定是否可以分开开票，那么就需要根据交易习惯、行业惯例以及双方当事人的协商来确定。在这种情况下，如果双方能够达成一致意见，同意分开开票，那么也是可以的。

二、税务方面的规定

1. 增值税发票的开具：根据税务方面的规定，增值税发票的开具应当遵循真实、准确、完整的原则。如果货物和服务的价格在合同中是合并计算的，但实际交易中却要求分开开票，那么就需要确保这种分开开票的方式不会违反税务方面的规定，比如不会导致税款的流失或者重复计税等问题。

2. 税务合规性：在分开开票的情况下，需要确保每一部分的发票都符合税务合规性的要求，包括发票的开具内容、金额、税率等都需要与实际交易情况相符。如果因为分开开票而导致税务合规性问题，那么可能会面临税务机关的处罚。

三、实际操作建议

1. 协商一致：在合同没有明确约定的情况下，建议双方当事人先进行协商，就货物和服务的价格是否可以分开计算以及是否可以分开开票等问题达成一致意见。

2. 咨询税务机关：如果双方对税务方面的规定不太了解，或者担心分开开票会违反税务方面的规定，那么可以咨询当地的税务机关，了解具体的税务政策和操作要求。

3. 完善合同条款：为了避免类似的纠纷再次发生，建议在未来的合同中明确约定货物和服务的价格是否可以分开计算以及是否可以分开开票等条款，以便在交易过程中有明确的依据。

四、可能的风险与后果

1. 合同纠纷：如果双方对分开开票的问题无法达成一致意见，或者因为分开开票而引发了其他合同纠纷，那么可能需要通过法律途径来解决。

2. 税务处罚：如果因为分开开票而违反了税务方面的规定，那么可能会面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等。

因此，在处理这类问题时，建议双方当事人先进行协商，并咨询专业的税务和法律人士的意见，以确保交易的合法性和合规性。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。