买卖合同未实际履行，开具的增值税发票一般不能由法院直接判决抵扣。以下从不同角度进行分析：

1. 增值税抵扣的法定条件 根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及相关规定，纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产或者不动产，支付或者负担的增值税额，为进项税额，且取得符合法律、行政法规或者国务院税务主管部门有关规定的增值税扣税凭证（如增值税专用发票）是抵扣的前提条件之一。但更为关键的是，这些购进项目必须用于增值税应税项目，即实际发生了应税交易行为。在买卖合同未实际履行的情况下，意味着没有真实的货物或服务交易发生，不满足增值税抵扣的实质要件。

2. 法院的裁判权限与税收法定原则 法院在民事诉讼中的裁判权限主要基于当事人之间的民事法律关系进行裁决，其判决内容通常围绕合同的效力、违约责任、损害赔偿等民事范畴。而增值税的征收与管理属于税务机关的行政职权范围，遵循税收法定原则。法院无权直接对税收的抵扣问题作出判决，因为这涉及到税收行政法规的具体适用和税务机关的征管职权。即使合同双方在合同中约定了发票开具及抵扣事宜，该约定也不能违反税收法律法规的强制性规定，否则约定无效。

3. 特殊情况与例外 虽然一般情况下买卖合同未实际履行不能由法院直接判决抵扣增值税，但也存在一些特殊情况或例外。例如，如果合同虽然未实际履行，但双方已经就合同解除或变更达成一致，并且按照相关规定办理了相关手续（如红字发票开具等），此时可能涉及进项税额的转出或重新抵扣等问题。然而，这些问题仍然需要由税务机关根据具体情况进行认定和处理，而不是由法院直接判决。