结论：合同中约定“超出法定工作时间工资已包含”的条款，其有效性需分情况讨论，并非绝对有效或无效。
分析如下：
若该条款不违反法律法规的强制性规定，且双方意思表示真实：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以订立劳动合同。劳动合同中，双方可以就工作时间、工资待遇等事项进行约定。
- 如果合同中的这一条款是双方真实意思的表示，且没有违反法律法规中关于工作时间、加班工资支付的强制性规定（如《劳动法》中关于加班工资支付标准的规定），那么该条款在法律上是有效的。这意味着，劳动者在超出法定工作时间工作后，其加班工资已经按照合同约定得到了补偿，无需再额外支付。
若该条款违反法律法规的强制性规定，或存在欺诈、胁迫等情形：
- 如果合同中的这一条款违反了法律法规中关于工作时间、加班工资支付的强制性规定，例如，约定加班工资低于法定标准，或者通过某种方式剥夺了劳动者获得加班工资的权利，那么该条款是无效的。
- 另外，如果该条款的订立存在欺诈、胁迫等情形，导致劳动者在违背真实意思的情况下订立了劳动合同，那么劳动者有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销该条款。
法律建议：
- 对于劳动者：在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工作时间和工资待遇的条款。如果发现合同中有违反法律法规的强制性规定或者存在不公平、不合理的条款，应及时提出异议，并与用人单位进行协商修改。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。
- 对于用人单位：在制定劳动合同时，应遵守法律法规的强制性规定，确保合同条款的合法性和合理性。同时，应尊重劳动者的合法权益，不得通过合同条款剥夺劳动者应得的权益。如果因合同条款问题引发劳动争议，用人单位可能会面临法律责任和声誉损失。
可能法律后果：
- 如果合同中的“超出法定工作时间工资已包含”条款被认定为无效，那么用人单位可能需要按照法律法规的规定向劳动者支付加班工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
- 如果劳动者因该条款问题提起劳动仲裁或诉讼，用人单位可能需要承担举证责任，证明该条款的合法性和合理性。如果无法证明，用人单位可能会败诉并承担相应的法律责任。
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