结论：事业单位合同工是否需要交港澳通行证，需分情况讨论，具体如下：

1. 单位因公管理需要
   若单位基于内部管理要求（如因公赴港澳的审批流程、人员备案等），可能要求合同工提交港澳通行证复印件或原件进行备案。此类要求通常与工作性质相关，例如涉及涉密岗位、外事接待或需频繁出差港澳的岗位。此时，提交证件属于单位管理权限范围，但需注意：

   • 单位不得非法扣押证件原件（《劳动合同法》第九条明确禁止用人单位扣押劳动者证件）；
     
   • 若仅需复印件，应明确用途并签署保密协议，防止个人信息泄露。

2. 单位无合理管理需求
   若单位无正当理由（如非因公、非备案目的）要求提交港澳通行证，员工有权拒绝。此类要求可能涉嫌侵犯公民个人信息权（《民法典》第一百一十一条）或超越用人单位管理权限。员工可要求单位出具书面说明，明确提交证件的法律依据及用途。

3. 特殊岗位的法定要求
   若合同工岗位涉及国家安全、保密等特殊领域（如军工、外交等），可能需根据《保守国家秘密法》或行业规定，向单位报备出入境证件信息。但此类情况通常由单位主动告知，且需以书面形式明确报备范围及程序。

建议：

• 若单位提出要求，可先核实其合理性，要求出具书面通知并说明依据；
  
• 拒绝非法扣押原件，仅可提供复印件并标注“仅供XX用途使用”；
  
• 如遇纠纷，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的应对方案。