对于孕期女员工协商解除劳动合同的经济补偿问题，结论前置如下：

1. 若用人单位违法解除劳动合同：需按照经济补偿标准的二倍向女员工支付赔偿金，并可能需承担“三期”工资及社保损失、生育津贴差额等其他损失。
2. 若双方协商一致解除劳动合同：则按照《劳动合同法》第四十七条的标准支付经济补偿。

详细分析如下：

一、用人单位违法解除劳动合同的情况

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。若用人单位违反这一规定，即构成违法解除劳动合同，需要承担相应的法律责任。

• 经济赔偿金：

  • 计算方式：按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
  • 示例说明：如果女职工在单位工作了3年，月工资为5000元，那么她应获得的经济赔偿金为\(5000元/月 \times 3个月 \times 2 = 30000元\)。

• “三期”工资及社保损失：

  • 若因劳动合同解除导致女职工无法享受孕期、产期、哺乳期的工资待遇和社保福利，用人单位需承担这部分损失。
  • 具体金额需根据实际工资标准、社保缴纳情况以及当地相关政策进行计算。

• 生育津贴（如适用）：

  • 如果女职工已参加生育保险并符合领取条件，但因劳动合同解除而无法正常领取生育津贴的，用人单位可能需要补足这部分差额。
  • 生育津贴的具体金额由生育保险基金根据政策规定支付，用人单位需确保女职工能够享受到应有的待遇。

• 其他可能的损失：

  • 如因劳动合同解除给女职工造成的其他直接经济损失（如医疗费用、营养费用等），用人单位也需根据实际情况进行赔偿。

二、双方协商一致解除劳动合同的情况

若用人单位与孕期女职工通过平等协商，就解除劳动合同的相关事宜达成一致意见，并签订书面的解除劳动合同协议，则按照《劳动合同法》第三十六条和第四十七条的规定支付经济补偿。

• 经济补偿标准：
  • 按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
  • 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

建议与提醒：

• 对于孕期女员工而言，在协商解除劳动合同时，应充分了解自己的权益和可能获得的补偿，确保自己的合法权益不受损害。
• 对于用人单位而言，在与孕期女员工解除劳动合同时，应严格遵守法律法规的规定，确保决策的合理性和合法性。同时，也应充分考虑女员工的特殊情况，体现人文关怀。

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