公司因资金问题无法发放工资，员工起诉时，公司应采取以下措施应对：

1. 核实员工诉求与证据
   首先需确认员工起诉的具体诉求（如欠薪金额、支付期限等），并核查公司财务记录、工资发放凭证、劳动合同等证据材料。若公司确实存在拖欠工资的事实，需评估欠薪规模及资金缺口，为后续协商或应诉提供依据。

2. 优先协商调解
   根据《劳动争议调解仲裁法》，公司可主动与员工沟通，提出分期支付、延期支付等解决方案。若员工接受调解，需签订书面协议并明确履行期限，避免后续争议。调解成功可节省诉讼成本，维护劳动关系稳定性。

3. 应对劳动仲裁或诉讼
   若协商未果，员工可能申请劳动仲裁或直接起诉。公司需在收到仲裁通知或起诉状后，在法定期限内提交答辩状及证据材料。仲裁或诉讼中，公司可主张以下抗辩理由（如适用）：

   • 不可抗力或经营困难：若公司因自然灾害、政策调整等不可抗力导致暂时停产，或因市场变化出现重大经营困难，可依据《工资支付暂行规定》申请延期支付工资，但需提供财务审计报告、政府证明等材料。
     
   • 员工过错导致损失：若员工存在严重失职、违反规章制度等行为，公司可依据《劳动合同法》主张扣减工资或解除劳动合同，但需提供充分证据（如监控录像、书面警告记录等）。
     
   • 已履行部分支付义务：若公司已支付部分工资或通过实物（如生活用品）折抵部分工资，需提供转账记录、收据等证据，避免重复支付。

4. 执行阶段应对
   若仲裁裁决或法院判决公司支付工资，公司需在法定期限内履行义务。若确实无力支付，可与员工协商分期履行，或向法院申请延期执行。若公司拒不履行，法院可能采取强制执行措施（如查封财产、限制高消费等），甚至将公司列入失信被执行人名单，影响公司信用及法定代表人个人信用。

5. 长期解决方案
   为避免类似纠纷，公司可采取以下措施：

   • 完善工资支付制度：明确工资发放时间、方式及逾期责任，并通过员工手册或劳动合同告知员工。
     
   • 建立应急资金机制：预留部分资金用于应对突发经营困难，确保工资按时发放。
     
   • 加强与员工沟通：定期向员工通报公司经营状况，增强透明度，减少误解。
     

温馨提示：若公司涉及欠薪纠纷，建议尽快咨询专业律师，制定针对性应对策略。如有具体问题，可直接向我提问，我将结合您的实际情况提供详细解答。