关于拖欠农民工工资5万元时违约金的数额，这并非一个固定值，而是需要根据具体情况和合同约定来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果农民工与用人单位在劳动合同或相关协议中明确约定了拖欠工资的违约金数额或计算方式，那么应当首先遵循这些约定。例如，合同可能规定拖欠工资需支付一定比例的违约金，或者按日计算违约金等。
   • 计算公式示例（假设合同约定违约金为拖欠金额的20%）：违约金 = 拖欠工资 × 违约金比例 = 50000元 × 20% = 10000元。

2. 无约定时的法律适用：

   • 如果劳动合同或相关协议中没有明确约定违约金，那么根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，农民工有权要求用人单位支付拖欠的工资，并可能要求支付一定的经济补偿或赔偿金，但这通常不直接称为“违约金”。
   • 在这种情况下，农民工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益，要求用人单位支付拖欠的工资及相应的经济补偿。经济补偿的具体数额会根据实际情况和法律规定来确定，可能包括拖欠工资的利息、因拖欠工资导致的损失赔偿等。

3. 实际操作的考虑：

   • 在实际操作中，违约金的数额还可能受到多种因素的影响，如用人单位的支付能力、拖欠工资的时间长度、农民工的实际损失等。
   • 因此，即使合同中有约定违约金，如果约定过高或过低，也可能在法律程序中被调整。法院或仲裁机构会根据公平原则、诚实信用原则以及实际情况来综合判断违约金的合理性。

4. 建议与行动：

   • 对于农民工而言，如果遭遇拖欠工资的情况，首先应当查看劳动合同或相关协议中是否有关于违约金的约定。
   • 如果有约定，且用人单位拒绝支付，农民工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益。
   • 如果没有约定，农民工仍然可以要求用人单位支付拖欠的工资，并寻求法律途径来获得相应的经济补偿。

总结来说，拖欠农民工工资5万元时的违约金数额并非固定不变，而是需要根据合同约定和实际情况来确定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。