当工程合同到期不续签，且员工在此期间发生了工伤，赔偿问题主要遵循的是《工伤保险条例》以及相关的劳动法律法规。以下是针对此问题的详细解答：
一、工伤认定
首先，员工需要确保自己的工伤已经得到了正式的认定。工伤认定是获得工伤赔偿的前提，通常由当地的劳动和社会保障部门负责。员工应提交相关的医疗证明、事故报告、工伤认定申请表等材料，并按照规定的流程进行申请。
二、赔偿项目与标准
一旦工伤被认定，员工就有权获得相应的工伤赔偿。赔偿项目通常包括以下几个方面：
医疗费用：包括治疗工伤所需的挂号费、住院费、医疗费、药费、交通食宿费等，这些费用应据实报销。
康复费用：如果员工需要康复治疗，相关的康复费用也应由工伤保险基金或用人单位承担。
停工留薪期间的工资：员工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
一次性伤残补助金：根据员工的伤残等级，由工伤保险基金支付一次性伤残补助金，具体标准由国务院社会保险行政部门规定。
伤残津贴：对于伤残等级较高的员工，如果难以安排工作，用人单位应按月发给伤残津贴。
一次性工伤医疗补助金和伤残就业补助金：如果员工选择解除或终止劳动关系，还可以获得一次性工伤医疗补助金和伤残就业补助金，具体标准由地方政府规定。
三、合同到期不续签的影响
工程合同到期不续签本身并不直接影响工伤赔偿。工伤赔偿是基于工伤事故的发生和工伤认定，与合同是否续签无直接关系。因此，即使合同到期不续签，员工仍然有权获得上述的工伤赔偿。
四、赔偿流程
申请工伤认定：员工应首先向当地的劳动和社会保障部门申请工伤认定。
提交赔偿申请：工伤认定完成后，员工应向用人单位或工伤保险基金管理机构提交赔偿申请，并附上相关的医疗证明、工伤认定决定书等材料。
等待审核与支付：用人单位或工伤保险基金管理机构会对员工的赔偿申请进行审核，审核通过后，将按照规定的标准支付赔偿款项。
五、注意事项
及时申请工伤认定：工伤认定是获得赔偿的前提，员工应尽快向当地的劳动和社会保障部门申请工伤认定。
保留相关证据：员工应妥善保留与工伤相关的医疗证明、事故报告等证据材料，以便在申请赔偿时提供。
了解当地政策：工伤赔偿的具体标准和流程可能因地区而异，员工应了解当地的相关政策规定。
综上所述，即使工程合同到期不续签，员工在发生工伤后仍然有权获得相应的赔偿。员工应尽快申请工伤认定，并按照规定的流程提交赔偿申请，以获得应有的赔偿。