关于建设工程合同中约定工程尾款作为审计保证金是否合法的问题，这主要取决于合同的具体约定以及相关法律法规的规定，以下从不同角度进行分析：

1. 合同自治原则：

   • 在民事法律关系中，合同自治是一项基本原则。这意味着，只要合同双方的意思表示真实、合法，且不违反法律、行政法规的强制性规定，他们就有权自由约定合同的内容。因此，如果建设工程合同中双方明确约定将工程尾款的一部分或全部作为审计保证金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定在法律上是有效的。

2. 审计保证金的性质与目的：

   • 审计保证金通常是为了确保工程审计的顺利进行和审计结果的准确性而设立的。如果合同中约定的审计保证金条款是为了这一目的，并且没有损害任何一方的合法权益，那么这种约定是合理的。然而，如果审计保证金的约定被用于不正当的目的，如限制一方的权利或增加不合理的负担，那么这种约定可能会受到法律的质疑。

3. 相关法律法规的考量：

   • 在建设工程领域，有一些特定的法律法规对合同的签订和履行进行了规范。例如，《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国合同法》（现已被《中华人民共和国民法典》合同编替代）等。虽然这些法律法规没有直接规定审计保证金的问题，但它们对合同的合法性、公平性、诚实信用原则等方面进行了规定。因此，在判断审计保证金条款是否合法时，需要综合考虑这些法律法规的精神和原则。
   • 特别需要注意的是，如果审计保证金的约定违反了法律法规的强制性规定，如涉及非法集资、挪用资金等违法行为，那么这种约定是无效的，并且可能受到法律的制裁。

4. 实践中的操作与风险：

   • 在实际操作中，将工程尾款作为审计保证金可能会带来一些风险。例如，如果审计过程出现延误或争议，可能会导致保证金的退还时间不确定，从而给一方带来资金压力。此外，如果审计结果对一方不利，另一方可能会利用保证金条款进行不合理的索赔。因此，在签订合同时，双方应充分考虑这些风险，并明确约定保证金的退还条件、时间以及争议解决方式等。

法律建议：

• 在签订建设工程合同时，如果双方考虑约定工程尾款作为审计保证金，应确保该约定合法、合理且明确。具体来说，应明确保证金的金额、退还条件、时间以及争议解决方式等关键条款。
• 同时，双方应充分了解并遵守相关法律法规的规定，确保合同的签订和履行不违反法律法规的强制性规定。
• 如果对审计保证金条款的合法性或合理性存在疑问，建议咨询专业律师或相关机构进行法律评估和风险评估。

总结来说，建设工程合同中约定工程尾款作为审计保证金在法律上并非绝对禁止，但需要确保该约定合法、合理且明确，并充分考虑实际操作中的风险和问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。