关于农民工（或更广泛地，员工）未打卡被罚款是否合法的问题，这主要取决于公司规章制度的合法性、合理性以及执行程序是否符合法律规定。以下是对此问题的详细分析：

首先，我们需要明确的是，公司有权制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理且经过民主程序制定，同时需要向员工公示或告知。如果公司的打卡制度违反了法律法规的强制性规定，或者过于严苛、不合理，那么这样的制度可能不会被法律所认可。

接下来，我们具体分析未打卡被罚款的情况：

1. 如果公司规章制度中明确规定了未打卡的处罚措施，并且这些措施不违反法律法规的强制性规定，同时公司能够证明该制度已经向员工公示或告知：

   • 在这种情况下，如果员工未打卡，公司按照规章制度进行罚款，可能是合法的。但需要注意的是，罚款的金额应当合理，不能过高，否则可能构成对员工权益的侵害。

2. 如果公司规章制度中未明确规定未打卡的处罚措施，或者规定违反了法律法规的强制性规定，或者公司无法证明该制度已经向员工公示或告知：

   • 在这种情况下，公司对员工进行罚款就是不合法的。员工有权拒绝接受不合理的罚款，并可以通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。

3. 关于打卡制度的合理性：

   • 打卡制度应当合理、简便易行，不能过于严苛或繁琐。如果打卡制度要求过于严格，导致员工难以遵守，那么这样的制度可能被视为不合理。例如，如果要求员工在每个小时内都至少需要一次签到，且签到程序繁琐，这样的制度就可能被视为不合理。

4. 实际案例参考：

   • 以您提供的案例为例，某信息公司制定的上班打卡制度程序繁琐、要求严苛、次数多，且未组织员工进行教学培训。在这种情况下，员工打卡不规范属于正常现象，公司以此为由开除员工并拒绝支付赔偿金，被法院认定为违法解除劳动合同。这说明，即使公司规章制度中有相关规定，但如果这些规定不合理或未向员工充分告知，也可能不被法律所认可。

综上所述，农民工（或员工）未打卡被罚款是否合法，取决于公司规章制度的合法性、合理性以及执行程序是否符合法律规定。如果公司规章制度合法、合理且已经向员工公示或告知，那么未打卡被罚款可能是合法的；但如果规章制度存在违法、不合理或未告知的情况，那么罚款就是不合法的。因此，建议公司在制定和执行打卡制度时，要充分考虑员工的权益和合理性，确保制度的合法性和有效性。同时，员工在面对不合理的罚款时，也有权通过法律途径维护自己的合法权益。