总公司的不定时工作制并不能自然在分公司执行，需根据具体情况和法律规定来确定。以下从不同角度进行分析：
一、不定时工作制的定义与审批
不定时工作制，是指因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，企业实行不定时工作制，必须报经劳动行政部门审批，未经审批，企业不得擅自实行。
二、总公司与分公司的法律关系
总公司与分公司是同一法人实体下的不同组成部分，分公司不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。然而，在劳动用工管理方面，分公司虽然受总公司的领导和管理，但通常也具有一定的独立性，包括招聘、用工、薪酬管理等。
三、不定时工作制在分公司的执行情况
若分公司所在地劳动行政部门已审批：
- 如果总公司的不定时工作制已经其所在地劳动行政部门审批，并且分公司所在地的劳动行政部门也认可或进行了相应的审批（或备案），那么分公司可以执行总公司的不定时工作制。
若分公司所在地劳动行政部门未审批：
- 即使总公司的不定时工作制已经其所在地劳动行政部门审批，但如果分公司所在地的劳动行政部门未进行相应审批或备案，分公司直接执行总公司的不定时工作制可能存在法律风险。因为不同地区的劳动行政部门可能对不定时工作制的审批标准和要求有所不同，分公司需要遵守其所在地的相关规定。
分公司独立申请审批：
- 为了确保合法合规，分公司也可以根据其自身的生产特点、工作特殊需要或职责范围，独立向所在地的劳动行政部门申请不定时工作制的审批。这样，分公司就能在获得审批后，合法地执行不定时工作制。
四、法律建议
了解并遵守当地规定：
- 分公司应详细了解并遵守其所在地劳动行政部门关于不定时工作制的审批标准和要求，确保合法用工。
与总公司沟通协调：
- 分公司应与总公司保持密切沟通，就不定时工作制的执行问题进行协调，确保双方在用工管理上的一致性。
及时申请审批：
- 如果分公司需要执行不定时工作制，但尚未获得所在地劳动行政部门的审批，应及时向相关部门提交申请，并按照要求提供必要的材料和证明。
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