结论是：剩下的40万欠款在特定条件下仍然可以要回来。以下是对此问题的详细分析：
一、结清证明的法律效力
结清证明通常被视为双方对债务关系的一种确认，表明债务人已经履行了部分或全部债务。然而，结清证明的法律效力并非绝对，它取决于证明中的具体内容以及双方的真实意图。
如果结清证明明确表明“全部债务已结清”：
- 在这种情况下，如果债权人签署了这样的证明，可能会被视为放弃了剩余债权的追索权。但即便如此，如果债权人能证明签署结清证明时存在欺诈、胁迫或重大误解等情形，仍然有可能通过法律途径撤销该证明，并继续追索剩余债务。
如果结清证明仅表明“部分债务已结清”或未明确提及剩余债务：
- 在这种情况下，结清证明不会影响剩余债务的追索权。债权人仍然有权要求债务人履行剩余债务的偿还义务。
二、剩余债务的追索途径
协商解决：
- 债权人可以与债务人进行协商，尝试达成新的还款协议。如果债务人同意继续偿还剩余债务，双方可以签订书面协议，明确还款金额、期限和方式等。
法律诉讼：
- 如果协商无果，债权人可以向法院提起诉讼，要求债务人偿还剩余债务。在诉讼过程中，债权人需要提供充分的证据证明债务关系的存在以及债务人未履行全部还款义务的事实。
- 法院将根据双方提供的证据和法律规定进行判决。如果判决债务人偿还剩余债务，而债务人拒不履行，债权人还可以申请法院强制执行。
三、建议与注意事项
保留证据：
- 债权人应妥善保管与债务关系相关的所有证据，包括借款合同、转账记录、结清证明（如有）、沟通记录等。这些证据将在协商或诉讼过程中发挥关键作用。
及时行动：
- 债权人应在发现债务人未履行全部还款义务后及时采取行动，避免超过诉讼时效期间。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。
寻求专业帮助：
- 如果债权人对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到充分保障，可以寻求专业律师的帮助。律师将提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助债权人更好地维护自身权益。
针对您的情况，如果结清证明并未明确表明全部债务已结清，或者您能证明签署结清证明时存在欺诈、胁迫或重大误解等情形，您仍然有权要求债务人偿还剩余的40万欠款。建议您先与债务人进行协商，如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。有问题可以直接向我咨询。