公司要求签署自愿加班协议，其合法性并非绝对，而是取决于多个因素的综合考量。以下从不同角度对此问题进行分析：
自愿性原则：
- 加班协议必须基于员工的真实意愿签订，不能存在任何形式的胁迫、误导或变相强制。如果员工是在被强迫或诱导的情况下签署自愿加班协议，那么该协议将因违反自愿性原则而无效。例如，公司通过绩效考核、奖金分配等方式给员工施加压力，使员工不得不“自愿”加班，这种行为实为变相强制，不合法。
合法性及合规性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条的规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，且一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。因此，自愿加班协议的内容必须符合这一法律规定，否则将因违反法律强制性规定而无效。
加班费支付问题：
- 如果加班时间超过了法定工作时间，公司应依法支付加班费。自愿加班协议本身并不等同于员工放弃加班费的权利。除非协议中有明确约定且不违反法律规定，否则员工仍有权要求支付加班费。例如，公司若通过自愿加班协议试图规避支付加班费的义务，这种行为将因违反法律规定而无效。
合同订立原则：
- 劳动合同的订立应遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用等原则。自愿加班协议作为劳动合同的一部分或补充，也应遵循这些原则。如果协议内容显失公平或违背员工真实意愿，将可能影响其法律效力。例如，协议中若存在不合理的加班时长要求或未明确加班费支付标准等条款，可能因违反公平原则而被认定为无效。
综合建议：
- 对于公司而言，在制定和执行自愿加班协议时，应严格遵守相关法律法规和合同订立原则，确保员工的合法权益得到充分保护。公司应尊重员工的自主选择权，避免任何形式的强制或变相强制加班，并依据自身制度和协议合理安排自愿加班的报酬问题。
- 对于员工而言，在签订自愿加班协议前应仔细阅读协议内容，了解自己的权利和义务。如果认为协议内容存在不合法或不合理之处，应及时与公司沟通协商或寻求法律援助。若双方对协议内容存在争议或纠纷，可向劳动争议仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼以维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》第四十一条：用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
- 《劳动保障监察条例》第二十五条：用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。
如有更多关于劳动工伤方面的法律问题，可以直接向我咨询。