关于厂房内二楼设置食堂是否违法的问题，不能一概而论，需要结合具体情况和相关法律法规进行判断。以下是从不同角度的分析：

1. 从建筑规划和使用性质角度：

   • 如果厂房在建设时，其规划用途并不包含食堂功能，且未经相关部门批准擅自改变建筑使用性质，在二楼设置食堂可能违反了建筑规划和使用的相关规定。这种情况下，相关部门有权要求整改或进行处罚。
   • 如果厂房在规划或改造时，已经明确包含了食堂功能，并且经过了相关部门的审批，那么在二楼设置食堂则是合法的。

2. 从消防安全角度：

   • 食堂作为人员密集场所，需要满足严格的消防安全要求。如果厂房二楼在设置食堂时，未考虑或未达到消防安全标准，如疏散通道不足、消防设施不完善等，那么这种设置可能违反了消防安全法规，存在安全隐患。
   • 在这种情况下，相关部门有权要求整改，甚至可能关闭食堂以确保安全。

3. 从环保和卫生角度：

   • 食堂在运营过程中会产生油烟、噪音等污染，如果未经处理直接排放，可能对周边环境造成影响。同时，食堂的卫生条件也需要符合相关标准，以确保食品安全。
   • 如果厂房二楼的食堂在环保和卫生方面未达到要求，那么这种设置可能违反了环保和卫生法规，需要整改或接受处罚。

4. 从劳动法规角度（如果涉及员工就餐）：

   • 如果厂房二楼的食堂是作为员工就餐场所，那么还需要考虑劳动法规的相关要求，如就餐时间、就餐环境等是否符合规定。虽然这通常不直接构成违法，但不符合劳动法规的要求可能引发劳动纠纷。

综上所述，厂房内二楼设置食堂是否违法，需要结合建筑规划、使用性质、消防安全、环保卫生以及劳动法规等多方面因素进行综合判断。如果存在疑问或不确定的情况，建议及时咨询相关部门或专业律师以获取准确意见。同时，如果厂房二楼已经设置了食堂，但担心可能存在违法问题，也可以主动向相关部门申报并接受检查，以确保合法合规运营。如有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。