当员工在仲裁中提出调解而公司拒绝时，员工应明确调解并非必经程序，并积极准备仲裁材料，依法申请并参与仲裁程序，必要时可考虑向法院提起诉讼。以下是对此问题的详细分析：

一、调解的非强制性

首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，调解并非劳动仲裁的必经程序。公司有权选择不参与调解，而直接进入仲裁程序。因此，当公司拒绝调解时，员工应理解并尊重公司的这一选择，不必过于担忧或强求调解。

二、公司拒绝调解的可能原因

了解公司不愿调解的具体原因，有助于员工更好地应对后续程序。可能的原因包括：

1. 责任认定存在异议：公司可能认为自身无过错或责任划分不合理，因此不愿通过调解解决争议。
2. 成本考量：公司可能认为调解的经济和时间成本高于仲裁或诉讼成本，或者担心调解会开创不良先例。

三、积极准备仲裁材料与证据

既然公司选择不调解，员工应立即着手准备相关证据和材料，以支持自己的主张。这包括但不限于：

1. 劳动合同：证明员工与公司之间的劳动关系。
2. 工资条、银行流水：证明员工的工资收入情况。
3. 工作记录、考勤记录：证明员工的工作时间和工作内容。
4. 证人证言：如有目击者或同事愿意作证，可提供其证言。

证据的充分性和准确性对于仲裁结果至关重要，因此员工应尽可能收集全面、有力的证据。

四、依法申请并参与仲裁程序

准备好证据后，员工应向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并按照委员会的要求参与仲裁程序。这包括：

1. 提交仲裁申请：明确仲裁请求和事实理由。
2. 参加庭审：按时参加庭审，陈述自己的观点和理由，提交证据。
3. 遵守仲裁程序：尊重仲裁机构的裁决，遵守仲裁程序。

在仲裁过程中，员工应保持冷静和理性，尊重仲裁机构的裁决。

五、考虑向法院提起诉讼（如必要）

若员工对仲裁委的裁决不满，可以在收到裁决书次日起十五日内向法院提起诉讼。这是法律赋予员工的权利。在诉讼期间，员工应积极提供证据支持自己的观点，并遵守法院的审理程序和判决结果。若判决裁定协议期满仍未履行，员工可向法院申请强制执行，以保障自身权益。

六、寻求专业法律帮助

在整个过程中，员工如遇到困难或疑问，应及时向我咨询。作为专业律师，我可以提供法律建议和指导，帮助员工了解法律程序、准备证据材料，并代表员工参与仲裁或诉讼程序。这将大大提高员工的维权效率和成功率。

总结：当公司在仲裁中拒绝调解时，员工应明确调解的非强制性，积极准备仲裁材料与证据，依法申请并参与仲裁程序，并在必要时考虑向法院提起诉讼。在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。