针对您提出的问题“员工已在其他单位参保，却还起诉我怎么办”，这确实是一个涉及劳动法律关系的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《社会保险法》的相关规定，用人单位有义务为其员工依法缴纳社会保险费。如果员工已经在其他单位参保，但您的公司并未与其解除劳动关系，且未按照法律规定为其在本地缴纳社保，那么员工有权基于未依法缴纳社保的事实提出解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。

一、分析员工起诉的可能原因

1. 社保缴纳地与实际工作地不符：如果员工在北京工作，但公司却将其社保缴纳在外地，这可能导致员工在享受社保待遇时遇到困难，如医药费报销、退休待遇等。这种情况下，员工可能会认为公司未依法履行社保缴纳义务。

2. 双重参保问题：虽然员工在其他单位参保，但如果您的公司并未与其解除劳动关系，且未按照法律规定处理社保关系，员工可能会认为公司存在过错，从而提起诉讼。

二、应对员工起诉的建议

1. 核实社保缴纳情况：首先，您需要核实员工的社保缴纳情况，包括缴纳地、缴纳项目等。如果发现存在与实际劳动关系不符的情况，应及时进行调整。

2. 与员工沟通协商：在了解员工起诉的具体原因后，您可以尝试与员工进行沟通协商，解释公司的立场和做法，寻求双方都能接受的解决方案。例如，可以协商将员工的社保关系转移至公司所在地，或者协商解除劳动关系并支付相应的经济补偿。

3. 准备应诉材料：如果沟通协商无果，您需要准备应诉材料，包括但不限于劳动合同、社保缴纳记录、员工工资单等。这些材料将有助于您在法庭上证明公司的立场和做法。

4. 寻求法律援助：在应对员工起诉的过程中，您可以考虑寻求专业的法律援助。律师将能够为您提供专业的法律意见和帮助，确保您的权益得到充分保障。

三、预防类似纠纷的建议

1. 完善公司社保制度：公司应建立完善的社保制度，确保员工的社保关系得到妥善处理。这包括及时为员工办理社保参保手续、按时足额缴纳社保费用等。

2. 加强员工沟通：公司应加强与员工的沟通，及时了解员工的社保需求和问题。通过定期的培训和宣传，提高员工对社保政策的认知度和满意度。

3. 依法处理劳动关系：在处理员工劳动关系时，公司应严格遵守相关法律法规的规定。对于需要解除劳动关系的员工，应依法支付经济补偿并办理相关手续。

综上所述，面对员工已在其他单位参保却还起诉您的情况，您需要核实社保缴纳情况、与员工沟通协商、准备应诉材料并寻求法律援助。同时，为了预防类似纠纷的发生，公司应完善社保制度、加强员工沟通并依法处理劳动关系。希望这些建议能够对您有所帮助。