在原单位已经工作满三年，现在要转正的情况下，试用期六个月应当是从新计算，而不是包含在三年内。以下从法律角度进行详细分析：
试用期设定的法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上三年以下的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。同时，该法还明确规定，同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。这意味着，在劳动者与用人单位的劳动关系存续期间，无论劳动合同如何变更或续签，都只能约定一次试用期。
试用期与工作年限的关系
试用期是劳动合同的一部分：试用期是用人单位与劳动者在劳动合同中约定的，用于相互了解、考察的期间。它并不是劳动者工作年限的组成部分，而是劳动合同期限的一个特殊阶段。
工作年限是累计计算的：劳动者的工作年限是指其在同一或不同用人单位工作的总时间。这个时间是从劳动者首次参加工作开始计算的，与试用期的设定没有直接关系。
转正与试用期结束的关系：转正通常意味着劳动者已经通过了试用期的考察，符合用人单位的录用条件，可以成为用人单位的正式员工。转正的时间点通常是在试用期结束之后，而不是在工作年限达到某个特定数值时。
具体到本案例的情况
已经工作满三年：这表示劳动者在原单位已经积累了三年的工作经验。但这三年的工作经验并不包含试用期，因为试用期是劳动合同期限的一个特殊阶段，与工作年限是两个不同的概念。
现在要转正：如果劳动者与用人单位之前已经约定过试用期，并且该试用期已经结束，那么现在要转正就不应该再设定试用期。如果之前没有约定过试用期或者约定的试用期已经结束且劳动者已经转正，但现在由于某种原因（如岗位调整、合同续签等）需要再次设定试用期，那么根据法律规定，同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期，因此不能再设定试用期。不过，从您描述的情况来看，更可能是指劳动者在原单位工作满三年后，由于某种原因（如合同到期续签、岗位晋升等）需要重新约定劳动合同期限，并可能涉及试用期的设定。在这种情况下，如果之前没有约定过超过六个月的试用期，并且现在约定的劳动合同期限是三年以上，那么可以设定不超过六个月的试用期。但这个试用期是从新约定的劳动合同期限开始计算的，与之前的工作年限无关。
试用期六个月是否从新计算：是的，如果现在约定的劳动合同期限是三年以上，并且之前没有约定过超过六个月的试用期，那么可以设定不超过六个月的试用期。这个试用期是从新约定的劳动合同期限开始计算的，而不是包含在之前的工作年限内。
特殊情况说明
如果劳动者与用人单位在之前的劳动合同中已经约定过试用期，并且该试用期尚未结束或者已经结束但劳动者尚未转正，那么现在就不能再设定试用期或者延长试用期。在这种情况下，用人单位应该根据劳动者的表现和合同约定来决定是否转正。
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