在起诉时选择“撤销行政行为”还是“确认其违法”，这确实是一个需要细致考量的问题。我会从几个不同的角度来为你分析这个问题，帮助你做出更明智的选择。

1. 行政行为是否具有可撤销性

• 可撤销的行政行为：如果行政行为存在重大且明显的违法情形，比如超越职权、滥用职权、违反法定程序或者主要证据不足等，且该行为尚未对相对人造成不可逆转的损害，或者损害可以通过撤销行为得到补救，那么选择“撤销行政行为”可能更为合适。撤销后，行政行为自始无效，相对人可以恢复到行为前的状态。
• 不可撤销的行政行为：如果行政行为已经执行完毕，且撤销该行为将给国家利益、社会公共利益或者他人合法权益造成重大损失，或者该行为虽然违法，但已经不具备撤销的现实可能性（如行政行为已经执行完毕且无法恢复原状），那么选择“确认其违法”可能更为恰当。确认违法后，虽然行政行为本身不被撤销，但相对人可以据此要求行政机关承担相应的法律责任，如赔偿损失等。

2. 相对人的诉求与利益

• 恢复原状的需求：如果相对人的主要诉求是恢复到行政行为作出前的状态，比如撤销一个错误的行政许可，恢复其原有的经营资格，那么选择“撤销行政行为”可能更符合其需求。
• 赔偿与补偿的需求：如果相对人更关注于获得因行政行为违法而造成的损失赔偿，或者希望行政机关采取补救措施以减轻损害，那么选择“确认其违法”可能更为有利。因为确认违法后，相对人可以依据此判决要求行政机关进行赔偿或采取补救措施。

3. 诉讼效率与成本

• 诉讼效率：撤销行政行为的诉讼可能相对更为直接和明确，一旦判决撤销，行政行为即自始无效。而确认违法的诉讼可能需要相对人进一步主张赔偿或补救措施，诉讼过程可能更为复杂和漫长。
• 诉讼成本：从成本角度考虑，如果相对人希望尽快解决纠纷并降低诉讼成本，那么选择撤销行政行为可能更为经济高效。但如果相对人认为确认违法后能够获得更多的赔偿或补救措施，且愿意承担相应的诉讼成本和时间成本，那么选择确认违法也是合理的。

4. 法律后果与影响

• 对行政机关的影响：撤销行政行为意味着对行政机关的否定性评价更为直接和强烈，可能对行政机关的声誉和公信力造成较大影响。而确认违法虽然也表明行政行为存在问题，但相对更为温和。
• 对相对人的影响：撤销行政行为后，相对人可以恢复到行为前的状态，但也可能面临一些不确定性和风险（如重新申请行政许可等）。而确认违法后，相对人可以获得一定的法律保障和赔偿，但也可能需要继续与行政机关进行沟通和协商以解决后续问题。

总结与建议：

1. 如果行政行为存在重大违法且可撤销，且相对人希望恢复到行为前的状态，建议选择“撤销行政行为”。
2. 如果行政行为已经执行完毕且不可撤销，或者相对人更关注于获得赔偿和补救措施，建议选择“确认其违法”。

最终的选择应该根据你的具体情况和需求来决定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。