针对您提出的“员工路上被撞负次要责任公司要怎么赔偿”的问题，这主要取决于车祸的责任归属、是否满足工伤认定条件，以及单位是否为员工缴纳了工伤保险。以下是我为您详细梳理的解答：
一、认定为工伤的情况及赔偿
认定条件：
- 员工在交通事故中不负主要责任（您提到员工负次要责任，这符合认定条件之一）；
- 车祸发生在合理的上下班途中，包括合理路线和合理时间。
赔偿责任主体：
- 如果公司已为员工缴纳了工伤保险，那么主要由工伤保险基金支付相关费用；
- 如果公司未为员工缴纳工伤保险，那么由公司承担全部的工伤赔偿责任。
赔偿项目：
- 治疗工伤的医疗费用和康复费用；
- 住院伙食补助费；
- 到统筹地区以外就医的交通食宿费；
- 安装配置伤残辅助器具所需费用；
- 生活护理费（如果生活不能自理且经劳动能力鉴定委员会确认）；
- 停工留薪期间的工资福利（原工资待遇不变，按月支付，一般不超过12个月，特殊情况可延长）；
- 一次性伤残补助金和一至六级伤残职工按月领取的伤残津贴；
- 终止或解除劳动合同时的一次性医疗补助金和伤残就业补助金；
- 因工死亡的遗属领取的丧葬补助金、供养亲属抚恤金和因工死亡补助金（此条针对因工死亡情况）；
- 劳动能力鉴定费。
二、不认定为工伤的情况
如果员工在事故中负主要责任，或者不符合上述工伤认定条件的其他情况，则此次事故不能认定为工伤。此时，公司通常没有法定的赔偿义务，但可能基于人道主义精神给予一定的经济补助或支持。不过，在您的情况下，员工负次要责任，所以这一条并不适用。
三、赔偿流程
- 及时报案与查勘：员工应立即向交通事故处理机关报警，并向承保车辆的保险公司报案，以便尽快进行查勘定损。
- 抢救治疗：如有人员受伤，应立即拨打急救电话送医治疗。
- 申请工伤认定：公司应在事故伤害发生之日起30日内向社会保险行政部门提出工伤认定申请（特殊情况可适当延长）。若公司未按时申请，期间发生的费用由公司负担。
- 劳动能力鉴定：伤情稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应进行劳动能力鉴定。
- 协商赔偿事宜：确定工伤待遇及赔偿金额后，公司与员工可协商赔偿事宜。若协商不成，员工可通过劳动仲裁或向法院提起诉讼解决争议。
四、单位拒绝支付赔偿的应对措施
如果公司拒绝支付工伤赔偿，员工应先申请劳动仲裁要求公司支付赔偿。对劳动仲裁结果不服的，可向法院提起诉讼以维护自身合法权益。
综上所述，员工在上班路上出车祸且负次要责任的情况下，如果满足工伤认定条件，公司应按照相关法律法规进行赔偿。在赔偿过程中，应严格按照流程进行操作，确保员工的合法权益得到切实保障。希望这个解答能对您有所帮助。