商业物业以房产证载面积计租金，在一般情况下是合法的，但具体是否合法还需结合租赁合同的具体条款以及相关法律法规来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同自由原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。在商业物业租赁中，出租人和承租人可以在租赁合同中自由约定租金的计算方式，包括以房产证载面积作为计算租金的依据。
   • 例子：如果租赁合同中明确约定了“租金按照房产证载面积计算，每平方米每月XX元”，那么这种计算方式就是合法的，双方应当按照合同约定履行。

2. 合法性审查：

   • 虽然合同自由原则允许双方自由约定租金计算方式，但这种约定必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
   • 审查要点：需要审查租赁合同中关于租金计算方式的约定是否明确、具体，是否存在模糊不清或容易引起歧义的条款；同时，还需要审查该约定是否违反了相关法律法规的规定，如是否涉及价格欺诈、是否违反了租金管制政策等。

3. 实际面积与房产证载面积的差异：

   • 在实际操作中，可能会存在房产证载面积与实际使用面积不一致的情况。如果租赁合同中约定以房产证载面积计算租金，但实际使用面积与房产证载面积存在较大差异，这可能会引发纠纷。
   • 建议：为了避免纠纷，双方在签订租赁合同时，可以约定对实际使用面积进行测量，并在合同中明确约定以实际使用面积或房产证载面积中的哪一种作为计算租金的依据。如果选择以房产证载面积计算租金，也可以考虑在合同中约定一个合理的误差范围，以及超出误差范围时的处理方式。

4. 法律法规的特别规定：

   • 除了合同自由原则外，还需要关注相关法律法规对商业物业租赁的特别规定。例如，某些地区可能对商业物业的租金计算方式有具体的规定或限制，或者对租金水平有调控政策。
   • 操作建议：在签订租赁合同前，双方应当了解并遵守相关法律法规的规定，确保租金计算方式的合法性。如果存在疑问或不确定的地方，可以咨询当地房地产管理部门或专业律师的意见。

总结与建议：商业物业以房产证载面积计租金在一般情况下是合法的，但具体是否合法还需结合租赁合同的具体条款以及相关法律法规来判断。为了避免纠纷和确保合法性，建议双方在签订租赁合同时明确约定租金计算方式，并了解并遵守相关法律法规的规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。