公司不批诊断证明是否违法，需分情况讨论：

1. 若诊断证明与工伤认定相关：

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。同时，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
   • 公司行为分析：在此情况下，如果职工已经按照正规流程取得了与工伤相关的诊断证明，并提交给公司以便进行工伤认定或享受相关待遇，公司无正当理由拒绝批准或认可该诊断证明，可能构成对职工合法权益的侵害。这种行为可能违反了《工伤保险条例》中关于工伤认定和待遇支付的相关规定，职工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
   • 建议行动：职工应首先与公司沟通，了解公司不批诊断证明的具体原因。如果公司无法提供合理理由，职工可以向当地劳动保障行政部门（如劳动局或社保局）投诉，要求公司履行其应尽的义务。同时，职工也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益，并考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

2. 若诊断证明与工伤认定无关：

   • 公司自主权：如果诊断证明并非用于工伤认定或享受工伤待遇，而是职工因个人健康原因需要请假或调整工作安排等，那么公司是否批准该诊断证明可能更多地取决于公司的内部规章制度和劳动合同中的相关约定。在这种情况下，公司有一定的自主权来决定是否批准职工的请假申请或调整工作安排。
   • 合法性判断：只要公司的决定不违反法律法规的强制性规定（如不得歧视患病职工、不得违反劳动法关于工作时间和休息休假的规定等），且公司能够提供合理的理由和依据，那么公司不批诊断证明的行为可能并不违法。
   • 建议行动：职工应首先查阅公司的规章制度和劳动合同中的相关条款，了解公司对于请假和调整工作安排的具体规定。如果职工认为公司的决定不合理或违反了相关规定，可以与公司进行沟通协商，寻求解决方案。如果沟通无果，职工也可以考虑向劳动争议调解委员会申请调解或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

总结与提醒：

• 在处理此类问题时，职工应首先明确诊断证明的用途和目的，以便判断公司不批诊断证明的行为是否违法。
• 如果涉及工伤认定或享受工伤待遇的问题，职工应了解并熟悉《工伤保险条例》等相关法律法规的规定，以便更好地维护自己的合法权益。
• 在与公司沟通或寻求法律援助时，职工应保留好相关证据（如诊断证明、劳动合同、公司规章制度等），以便在需要时提供证明。

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