在环评报告编制过程中，如果工程师离职，确实可能会对项目的审批流程产生一定影响，但具体影响及应对措施需依据相关法规和实际情况来综合判断。以下是一些详细的建议和解释：

首先，要明确的是，根据《建设项目环境影响报告书(表)编制监督管理办法》的相关规定，环境影响报告书(表)的编制主持人和主要编制人员应当为编制单位中的全职人员。这意味着，如果负责编制的工程师在项目审批过程中离职，且该工程师是编制主持人或主要编制人员，那么该环评文件在形式上可能不再符合法规要求。

针对这种情况，您可以考虑以下几个步骤来应对：

1. 评估影响：

   • 确认离职工程师在项目中的具体角色和贡献。
   • 评估其离职对项目审批可能产生的具体影响，包括是否会导致审批延误或失败。

2. 及时沟通：

   • 立即与当地生态环境主管部门取得联系，说明工程师离职的情况。
   • 询问主管部门对于此类情况的具体要求和指导，以便及时调整策略。

3. 重新编制或补充材料：

   • 如果主管部门要求，您可能需要安排符合法规要求的编制人员重新编制环评报告。
   • 或者，如果离职工程师的部分工作可以被其他人员接手并补充完善，那么您也可以考虑在现有报告的基础上进行补充和修改，以满足审批要求。

4. 更新社保证明等材料：

   • 如果审批时间较长，且编制人员离职前附上的社保证明已超出有效期（如3个月），那么您可能需要更新这些材料，以证明新的编制人员或接手人员是编制单位中的全职人员。

5. 保持项目进度：

   • 在处理工程师离职问题的同时，要尽量保持项目的整体进度不受太大影响。
   • 可以与主管部门协商，看是否可以给予一定的宽限期或特殊处理，以便项目能够顺利推进。

最后，我想强调的是，每个项目的具体情况和当地生态环境主管部门的具体要求可能都有所不同。因此，在处理此类问题时，最好能够直接与主管部门进行沟通，并根据其指导和要求来采取相应的措施。这样不仅可以确保项目的合规性，还可以提高审批的效率和成功率。