结论：公司走账走到私人账户后，多余的钱退给公司但公司扣掉工资的行为，可能涉及违法，员工有权要求公司补发工资，并可通过法律途径维护自身权益。
一、法律分析
工资支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是用人单位的法定义务，不得因任何理由（包括员工退还公司款项）而免除或减少。
公司扣工资的合法性：
- 如果公司因员工退还公司款项而扣减工资，这种行为可能构成违法。因为退还公司款项与工资支付是两个独立的法律关系，公司不能将两者混为一谈，更不能以此为由扣减员工工资。
员工权益保护：
- 员工有权要求公司按照劳动合同约定和国家规定支付工资。如果公司拒绝支付或扣减工资，员工可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等法律途径维护自身权益。
二、可能后果
公司面临法律责任：
- 如果公司扣减员工工资的行为被认定为违法，公司可能面临劳动行政部门的处罚，包括责令限期支付工资、加付赔偿金等。
员工可主张的权利：
- 员工可以要求公司补发被扣减的工资，并可以主张因公司违法行为导致的其他损失（如误工费、精神损害抚慰金等，具体需根据实际情况和法律规定确定）。
三、建议与措施
与公司协商：
- 首先，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司补发被扣减的工资。在协商过程中，员工可以明确表达自己的诉求和法律依据，争取达成和解。
向劳动行政部门投诉：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动行政部门投诉。劳动行政部门将依法进行调查处理，并可能责令公司限期支付工资。
申请劳动争议仲裁或诉讼：
- 如果公司拒绝执行劳动行政部门的决定或员工对处理结果不满意，员工可以申请劳动争议仲裁或向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，员工需要提供相关证据证明公司的违法行为和自己的损失情况。
总结与提示：公司走账走到私人账户后，多余的钱退给公司但公司扣掉工资的行为可能涉及违法。员工有权要求公司补发工资，并可通过协商、投诉、仲裁或诉讼等法律途径维护自身权益。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。